小規模企業におすすめの勤怠管理システム11選！

「月末の集計が特定の担当者に依存している」「もっとシンプルで費用を抑えたい」業務の属人化や過剰な機能、維持費の高負担が導入を阻む要因です。

現在の勤怠管理システムは初期費用が無料で、1人あたり110円から利用できる製品が豊富にあります。30名以下の規模でも出退勤データを自動集計でき、複数人で情報を共有すれば、担当者不在でも業務が滞りません。

小規模企業におすすめの勤怠管理システムについて、選び方を含めて紹介します。

小規模企業におすすめの勤怠管理システムの比較表

小規模企業向けの勤怠管理システムを選ぶ際、単価だけでなく、月額の最低料金や長時間労働対応のアラートの有無を重視することが大切です。主要な勤怠管理システムの最新スペックの比較表は、下記のとおりです。

※ミツモア調べ（2026年4月現在）
（※1）マネーフォワード クラウドの基本料金プランに準ずる。
（※2）打刻のあった人数分のみ課金される従量課金制。
（※3）200名まで定額利用可能なプラン。

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小規模企業が勤怠管理システムを導入するメリット

少ない人数で経営を維持する組織にとって、勤怠管理システムの導入は生産性を高める投資です。得られるメリットは、主に以下の3点に整理できます。

勤怠管理業務の手間が減る

従業員が少ないほど一人ひとりの業務範囲が広いため、事務の効率化が成長を左右します。手作業の集計は時間を奪うだけでなく、入力ミスによる再確認の負担も生じるでしょう。

勤怠管理システムを導入すれば、打刻と同時に労働時間を自動で算出可能です。毎月の作業は確認のみとなり、営業などのコア業務へ注力する時間を創出できます。

法改正対応の負担を削減できる

2026年は、労働基準法の抜本的な改正により、小規模企業も「生存条件」としての厳格な法対応が求められる年です。特に商業やサービス業の小規模事業場に認められていた「週44時間特例」が廃止され、全業種で週40時間制が義務化される点は大きな転換点となります。

最新のクラウド型システムは、複雑な法改正に合わせた自動アップデート機能を完備しているのが特徴です。経営者が法律を読み解く負担をゼロにし、アラート機能によって意図しないコンプライアンス違反を未然に防ぎます。

勤怠管理の属人化と業務負担を軽減できる

管理担当者が1名の現場ほど、業務が不透明になるリスクは高まります。個人に依存したエクセル管理は、担当者の不在が給与支給の遅れといったトラブルを招きかねません。

勤怠管理システムでデータを一元管理すれば、業務を標準化できます。誰でも状況を確認できる環境は属人化を防ぎ、個人の心理的、物理的な負担を軽減できるでしょう。

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小規模企業におすすめの勤怠管理システム11選

3名から30名の小規模企業におすすめの勤怠管理システム11製品を紹介します。

• HRMOS勤怠
• スマレジ・タイムカード
• ジョブカン勤怠管理
• マネーフォワード クラウド勤怠
• ジンジャー勤怠
• KING OF TIME
• kincone（キンコン）
• Touch On Time
• RecoRu（レコル）
• freee勤怠管理Plus
• TimeBiz

HRMOS勤怠（株式会社ビズリーチ）

HRMOS(ハーモス)勤怠は、株式会社ビズリーチが提供するクラウド型勤怠管理システムです。30名以下の企業なら、基本機能を無料で使い続けることができ、予算が限られる現場でも、費用を気にせずエクセルや紙の管理から脱却できます。

SlackやLINEからの打刻、QRコードを用いたタブレット打刻など、多様な働き方にあわせた手段が揃っているのが特徴です。打刻忘れを防ぎ、月末のデータ修正作業を劇的に減らす仕組みが整っています。

費用を最小限に抑えつつ、強固なセキュリティ環境で管理したいスタートアップに向いており、チャットツールを活用する少人数のチームにも適切な選択肢です。

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スマレジ・タイムカード（株式会社スマレジ）

スマレジ・タイムカードは勤怠管理、シフト作成、給与計算などの機能を搭載し、日々の業務負担を軽減するクラウド型勤怠管理システムです。出退勤の記録に加え、シフトや休暇の管理も一つの画面で完結するだけでなく、スタンダードプランなら30名まで無料で使用できます。

上位プランのシフト作成機能を使えば、希望の回収から確定まで3段階で完了することが可能です。作業時間を従来の4分の1に短縮した事例もあり、事務負担を大幅に減らせます。

POSレジと連携し、売上データに基づいた人件費比率を可視化できる点も強みです。客観的なデータをもとに人員配置を判断できるため、維持費の削減を実現できます。

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ジョブカン勤怠（株式会社DONUTS）

ジョブカン勤怠管理は、株式会社DONUTSが提供するクラウド型の勤怠管理システムです。あらゆる業種や勤務形態にあわせて、必要な機能だけを自由に選べます。

シフト管理や休暇申請など、課題に応じた適切な環境を構築することが可能です。ICカードや顔認証、チャットツール連携など、打刻手段が豊富にあるため、入力漏れの防止や正確な自動集計も行えます。

2026年の法改正で焦点となる残業規制やインターバル制度も、アラート機能が監視するため、管理者が細かく確認する手間を省き、法違反のリスクを確実に回避可能です。

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マネーフォワード クラウド勤怠（株式会社マネーフォワード）

マネーフォワード クラウド勤怠は、あらゆる業種や複雑なルールに柔軟に対応する中小企業向けシステムです。会計や給与計算、人事労務と密接に連動する統合型クラウド設計が特徴で、給与ソフトとの自動連携に大きな強みがあります。

データ確定と同時に同期されるため、転記や加工の手間はありません。アナログな作業をなくし、事務効率を飛躍的に高めます。

2026年改正の週40時間管理や残業アラート機能も標準で備わっており、法に触れる恐れがある際はシステムが自動で警告するのもポイントです。法令を確実に守りながら、事務工数を大幅に削減します。

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ジンジャー勤怠（jinjer株式会社）

ジンジャー勤怠は、jinjer株式会社が提供するクラウド型勤怠管理システムです。2026年の法改正対応に加え、従業員のコンディションを可視化する機能まで備えており、単なる打刻管理に留まらない戦略的な労務管理を実現できます。

管理者が現場や外出を兼ねる場合、スマホアプリによる管理が役立つことが可能です。移動中もアプリから打刻確認や休暇承認をリアルタイムで行えるため、事務所に戻ってからの事務作業をなくせます。

GPS打刻や顔認証機能も標準装備しており、直行直帰が多い現場や多店舗展開でも、不正を防いで労働時間を正確に記録することが可能です。現場を離れることが多い経営者や、外回り中心の営業組織を持つ小規模企業におすすめします。

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KING of TIME（株式会社ヒューマンテクノロジーズ）

KING OF TIME(キングオブタイム)は、月額330円/名という低価格ながら、給与計算システムとの連携機能を備えたクラウド型勤怠管理システムです。単なる時間の記録に留まらず、複雑な就業規則や多様な打刻ニーズを網羅します。

特徴は、実際に打刻した人数分だけ課金される無駄のない料金体系です。従業員の増減が激しい成長期でも、固定費を抑えつつ実績の多いシステムを常に利用できます。

指紋や顔認証、GPS、ICカードなど20種類以上の打刻方法から、適切な手段を選ぶことが可能です。なりすましを物理的に防ぐことができ、2026年改正の焦点となるインターバル管理や、14日以上の連続勤務を防ぐアラート機能も標準で備わっています。

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kincone（株式会社ソウルウェア）

kincone(キンコン)は、ICカードを利用して打刻することにより、出勤と退勤管理と交通費精算が同時にできる勤怠管理システムです。SuicaやPASMOをリーダーにかざすだけで、打刻と同時に交通機関の履歴や運賃データを自動で読み取ります。

経費精算の事務工数を大幅に削れる点はポイントで、外回りや現場移動が多い組織では、毎月末に従業員が経路を調べて手入力し、管理者が照合する重い作業が発生しがちです。打刻と同時に経費データが作られるため、入力ミスや虚偽申請を物理的に防げます。

1名あたり月額220円と業界有数の安価な料金体系ながら、SlackやChatworkでの打刻にも対応しているのも特徴です。リモートワークや直行直帰が多い小規模組織でも、日々の連絡の中で自然に勤怠管理を行えます。

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Touch On Time（株式会社デジジャパン）

Touch On Time（タッチオンタイム）は、専用の打刻端末を使った勤怠管理システムです。指紋や指静脈、ICカードといった多彩な認証を一台で完結でき、なりすましなどの不正を物理的に排除する管理体制を築けます。

ITの専門知識がなくても、端末を置くだけで精緻な管理を始めることが可能です。生体認証を活用すれば、カードの紛失や貸し借りを心配する必要はなく、正確な勤務実績も自動で集計されます。

毎月の打刻漏れチェックや修正作業から管理者を解放できるのも特徴です。2026年改正で厳格化される長時間労働へのアラート機能を備え、法令違反を未然に防ぐ守りの労務管理を最小限の工数で実現します。

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RecoRu（中央システム株式会社）

RecoRuは申請承認や36協定チェックなど、必要な機能を標準搭載した勤怠管理システムです。直感的に操作できるシンプルな設計を特徴としています。

初期費用は無料で、月額料金は1人あたり110円、最低利用料金は3,300円からです。PCやスマホ、ICカードでの打刻に加え、2026年改正で焦点となる残業時間の集計や通知、有給管理機能も備えています。

経営者が細かく確認しなくても、法律違反の可能性を自動で検知できるため、トラブルを未然に防げる体制が整っています。

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freee 勤怠管理 Plus（フリー株式会社）

freee(フリー)勤怠管理Plusは、事前準備から締め作業まですべての作業をクラウドで一元化できる勤怠管理システムです。高度な集計機能に加え、直感的に操作できる画面と、製品との間でスムーズに連携できます。

勤怠データの確定と同時に、給与計算や社会保険手続き、年末調整に必要な情報を同期することが可能です。担当者が1人の現場でも、データの転記や加工といった手間が一切なくなります。

2026年の法改正で注目されるつながらない権利を尊重し、時間外の通知を抑えられるのも特徴のひとつです。GPS打刻や指紋、静脈認証といった手段もできるため、在宅勤務や直行直帰が多い環境でも客観的な記録を自動で蓄積し、確認負担を大幅に減らします。

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TimeBiz（株式会社ASJ）

TimeBiz（タイムビズ）は、勤怠管理にスケジュール共有やワークフロー、掲示板などを統合した社内ポータル型のシステムです。事務的な記録を社内コミュニケーションと融合させている点が大きな強みで、情報共有と労務管理を一つの場所で完結できます。

複数のツールを使い分ける余裕がない少人数の現場では、ツールの集約が管理の手間を減らし、連携をスムーズにすることが可能です。予定の確認とあわせて打刻し、そのまま休暇申請まで行えるため、業務スピードが大幅に向上します。

ブラウザやスマホからの打刻に加え、残業の自動計算や警告機能も備えているのも特徴です。2026年改正で厳格化される長時間労働の抑制にも役立ちます。

稼働状況がリアルタイムで可視化されるため、管理者が個別に確認しなくても、どこに負荷が集中しているか、といった状況を組織全体で把握でき、人員の適切な配置を助けます。

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小規模企業向け勤怠管理システムの選び方

リソースの限られた小規模企業においては、労働基準法改正への対策と事務作業の極小化が不可欠です。システムを選ぶ際は、以下の点に注目しましょう。

2026年の法改正に自動対応しているか

2026年は労働基準法が約40年ぶりに見直される節目の年です。小規模企業も、週44時間特例の廃止といった厳しい対応を迫られます。

最優先すべきは、法改正に自動更新で対応できるか、勤務間インターバルの不足や連続勤務を検知し、警告する機能です。経営者が法文を読み解く手間を省き、法令遵守を自動化できる製品を選びましょう。

既存のソフトとAPI連携できるか

管理担当者が少ない現場では、システム間の連携が効率を左右します。freeeやマネーフォワードなどの給与計算ソフトと直接つながるかは重要です。

手動の加工を介さず、ボタン一つでデータが同期されれば、転記ミスや支給遅延を防げます。自社ソフトとリアルタイムにつながる製品を選びましょう。

月額最低料金はいくらかかるか

注意すべきは1人あたりの単価ではなく、月額最低料金の有無です。単価が200円でも最低料金が2,000円なら、5名の利用でも10名分と同じ費用がかかります。

こうした隠れた支出は、少人数の組織にとって利益を圧迫する要因です。現在の人数と今後の計画を照らし、実質的な負担が適切か見極めましょう。

サポート体制が整っているか

専任のIT担当者がいない場合、初期設定や操作トラブルが運用の成否を分けます。電話やチャットによる窓口があるかどうかは、安定稼働のための生命線です。

就業規則が複雑なら、設定を支援してくれる製品を選ぶと稼働までの期間を短縮できます。迅速に回答を得られる体制は、担当者の心理的な負担を減らす上でも欠かせません。

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小規模企業が勤怠管理システムを導入した事例

勤怠管理システムの導入効果や導入に至った前後の背景などの観点から、実際に導入している小規模企業を紹介します。

アドイノベーション株式会社

アドイノベーション株式会社は、スマホ広告に特化したマーケティング事業を展開している企業です。

自社でサービスを開発・運用している企業が提供するシステムであり、導入費用やデザインなどを総合的に評価した結果、自社のニーズに最も合致したジョブカン勤怠管理の導入を決定しました。

株式会社アルファメイル

「株式会社アルファメイル」は、BtoCのサプリを中心に通販・物販事業を展開している、従業員20名の小規模企業です。

会社設立当初は勤怠管理を含めバックオフィスはエクセルで管理を行っていましたが、売上や事業成長に繋がることを中心に時間を使いたいと思い、マネーフォワード クラウド勤怠の導入を決定しました。

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