派遣会社向け勤怠管理システムおすすめ12選！

月末になると「紙のタイムシートが届かない」「転記作業が終わらない」と悩む労務担当者は多いはずです。回収遅れに伴う集計ミスや36協定超過の恐れ、派遣先承認に対応できない汎用システムの限界といった現場の悩みを、派遣会社向け勤怠管理システムの移行で解消できます。

派遣先のワンタップWeb承認やリアルタイムのアラート通知、給与ソフトとの連携機能を搭載しており、移行により月末月初の締め作業時間を削り、集計ミス防止と法令遵守を達成できるでしょう。

製品の選び方や注意点を含め、派遣会社向けおすすめの勤怠管理システムを紹介します。

派遣会社向け勤怠管理システム比較表

派遣会社向け勤怠管理システムを導入するにあたって、費用感とオンライン承認、残業アラートといった機能が網羅できているか確かめることが大切です。下記の製品比較表でまとめましたので、最適な勤怠管理システム選定の参考にご活用ください。

※ミツモア調べ（2026年7月現在）
※「―」：公式Webサイトに記載なし

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派遣会社が勤怠管理システムを導入するメリット

派遣会社に勤怠管理システムを導入するメリットは、主に3点です。

タイムカードの回収待ち廃止で締め作業を減らせる

一般企業とは異なり、派遣会社は派遣元と派遣先、派遣社員の三者間で勤怠を管理します。実際の勤務場所が派遣先にあるため、紙やFAXでは労働時間の把握が遅れがちです。

専用の勤怠管理システムを導入すれば、派遣先の上司がWeb上で承認可能です。回収待ちのストレスやExcelへの転記作業が解消し、月末月初の締め時間を軽減できます。

給与未払いや請求ミスを防止して企業の信頼を守る

一般企業において勤怠データは給与計算に使われます。一方、派遣会社にとっては社員への給与支払いに加え、派遣先への請求金額を算出する重要データです。

手作業による入力ミスや集計漏れは、給与未払いにとどまらず請求金額の間違いに直結します。専用システムで集計を自動化すれば、人為的ミスを未然に防止可能です。

給与計算ソフトや派遣基幹ソフトへ正確なデータを一括連携でき、取引先からの信用を損なう事態を防げるでしょう。

リアルタイムな状況把握で法令違反を回避できる

派遣業界は36協定の残業上限規制や年5日の有休取得義務といった、コンプライアンス対応が求められます。月末の集計作業時に初めて確認する運用では、違法残業が発生していたという事態に陥りかねません。

派遣会社向けの勤怠管理システムを導入すれば、日々の労働時間や有休取得率がリアルタイムで可視化されます。残業時間が上限に近づくと自動で警告通知が届くため、月の途中で派遣先へ勤務調整を相談し予防措置をとれる点が強みです。

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派遣会社向け勤怠管理システムおすすめ12選

派遣会社におすすめの勤怠管理システムは、下記のとおりです。

• e-staffing
• メッキー派遣管理
• CROSSNAVI
• クラウドスタッフィング
• HRstation
• e-naviタイムシート派遣
• DigiSheet
• staff-one
• PlusNavi
• スタッフナビゲーター
• STAFFEXPRESS
• jobs

e-staffing（株式会社イー・スタッフィング）

e-staffingは、人材派遣大手3社が共同で立ち上げた勤怠管理システムです。派遣スタッフのスマホ打刻データに対し、派遣先の責任者がオンライン上で即座に承認を行える仕組みにより、リアルタイムで正確な労働時間を把握できます。

最大12年4ヶ月にわたる勤怠実績の電子保存機能を通じて法定帳票を厳密に管理することが可能です。労働時間や残業の適切な把握といったコンプライアンス体制を強力に支援します。

多数の派遣先企業と取引があり、クライアント側の新たなシステム導入ハードルを極力下げたい派遣会社におすすめします。

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メッキー派遣管理（株式会社アドソフト）

メッキー派遣管理は、案件情報やスタッフ情報、給与や契約情報、勤怠情報などを一元管理できる人材派遣に特化したクラウド型の勤怠管理システムです。スマホ打刻やシフト管理を通じて収集された日々の勤怠実績は、給与や請求処理へスムーズに接続され、月末の集計ミスや手入力の負担を防止します。

AIマッチングや地図情報を活用した最適な人材提案の自動化機能も搭載しており、労務管理にとどまらず営業活動の効率化も支援します。すべての利用者が電話やウェブ会議を通じた丁寧な導入サポートを受けられるため、新たな業務フローを確実に現場へ定着させることが可能です。

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CROSS NAVI（株式会社キャムテック）

CROSS NAVIは、1日単位や30日以内の短期派遣の雇用を支援する勤怠管理システムです。人材紹介から雇用・勤怠管理に至るまでの一連の業務をシームレスにサポートし、労務管理担当者の負担を効果的に軽減します。

収集した勤怠データを基に、日払いや週払いといった柔軟な給与支払いオプションをシステム上で効率的に処理することが可能です。多様な働き方への対応と労務コストの大幅な削減を両立できるため、スポット派遣や短期の案件を主力事業とし、日々変動する数多くのスタッフの稼働管理に忙殺されている派遣会社におすすめします。

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クラウドスタッフィング（株式会社クラウドスタッフィング）

クラウドスタッフィングは、派遣先企業と派遣元企業両方で勤怠情報をリアルタイムで共有できるクラウド型勤怠管理システムです。データ通信の暗号化や不正アクセスを防止する高度なセキュリティ対策を複数備え、機密性の高い情報を安全な環境で保持します。

システムに搭載された労働時間チェッカーを活用することで、スタッフごとの詳細な稼働状況や有給休暇、深夜労働の時間を正確に追跡することが可能です。スマホ打刻で収集した勤怠データのオンライン承認ワークフローに加え、システム内の専用チャットを通じて現場との業務連絡をシームレスに行えるため、三者間で発生する確認作業や連絡の手間を大幅に削減します。

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HRstation（アルティウスリンク株式会社）

HRstationは、KDDIグループが提供する勤怠管理システムです。派遣先企業は無料で利用できるためシステム連携のハードルが極めて低く、HTTPS接続の暗号化や定期的な脆弱性診断が施されたセキュアな環境でスタッフ情報を一元管理できます。

1か月間無料でトライアルすることが可能です。スマホからの勤怠入力とオンラインでの承認ワークフローによりペーパーレス化を実現し、正確な稼働データを請求書の自動作成へと直結させます。

36協定アラート機能によりスタッフや事業所ごとの抵触日および時間外労働を詳細に追跡し、上限超過を未然に防ぐ適法な運用体制を自動で構築することも可能です。

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e-naviタイムシート派遣（株式会社イー･クリエーション）

e-naviタイムシート派遣は、初期費用0円で導入できるクラウド勤怠管理システムです。料金体系は、派遣元でスタッフ1人あたり月額250円の従量課金制を採用しています。

派遣スタッフがスマホから打刻した出退勤データを、派遣先の責任者がオンライン上で即座に承認することが可能です。一元化された勤怠データは自動で集計され、自社の給与計算や請求業務へとシームレスに反映されるため、月末に集中するタイムシートの回収や手入力の負担を削減します。

データの暗号化や厳密なアクセス制限により、セキュアな環境下で三者間の情報を統合管理することも可能です。

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DigiSheet（株式会社ヒューアップテクノロジー）

DigiSheetは、人材派遣業に特化したクラウド型の勤怠管理システムです。導入作業の段階から稼働後に至るまで専任のスタッフが対応する手厚いサポート体制が強みで、年に一度の直接訪問によるフォローアップや丁寧なレクチャーを通じて、システムの確実な定着を後押しします。

派遣スタッフによる打刻や各種申請ワークフロー、シフト管理といった日々の勤怠データをクラウド上で一元処理し、派遣先企業がオンラインでスムーズに承認できる環境を構築します。ITシステムの導入に際して、自社の内勤社員や派遣先企業の担当者から理解を得て正しく運用できるか不安を抱えている派遣会社に最適です。

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staff-one（株式会社ジェイテック）

staff-oneは、特定非営利活動法人「日本一般労働者派遣協会」の推奨を受けており、直感的な使いやすさに定評があるクラウド型のシステムです。マニュアルを熟読しなくても直感的に操作できる洗練された画面設計を採用しており、1か月間は試用版として無料で利用できます。

スマホやタブレット端末からの打刻でオンラインによる申請ワークフローやシフト管理をスムーズに行うことが可能です。収集した勤怠実績のデータから、多様な勤務形態に合わせた労働時間の自動計算が行われ、事前に登録された契約情報を基に請求書まで自動で作成されます。

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PlusNavi（ユニテックシステム株式会社）

PlusNaviは、ユニテックシステム株式会社が提供するクラウド型の勤怠管理システムです。同社の人材マッチングシステムである「キャスティングナビ」と連携させることで、スタッフの手配から日々の勤怠管理までを支援します。

スマホ打刻やオンラインの申請ワークフロー、シフト管理機能を通じて日々の正確な勤怠データを収集することが可能です。データを基にした給与明細はウェブ上でスタッフへ公開され、課税手当や非課税手当といった詳細な金額まで明示されるため、スタッフへの迅速な情報開示とバックオフィスのペーパーレス化を同時に達成します。

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スタッフナビゲーター（ユニテックシステム株式会社）

スタッフナビゲーターは、派遣社員の登録から給与支払いまでの全業務フローを一貫して管理できるクラウド型のシステムです。スマートフォン打刻やオンラインでの申請ワークフロー、シフト管理機能により正確な出退勤データを収集し、給与計算や請求管理へとスムーズに連携させます。

資格や経験だけでなくスタッフの印象や雰囲気といった定性的な情報までデータベース化し、条件に合致する人材へ業務情報をメールやSMSで一斉配信するスピードマッチング機能を搭載しているのも特徴です。

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STAFF EXPRESS（株式会社エスアイ・システム）

STAFF EXPRESSは、人材派遣、紹介、請負ビジネスにおける全業務フローをワンストップで処理する、オールインワンの人材派遣特化型システムです。GPS連携による正確な出退勤打刻によって不正を根本から防止し、オンラインの申請ワークフローを通じて残業やシフトの管理をリアルタイムで行えます。

収集された勤怠データが給与計算や請求処理へとシームレスに直結するだけでなく、給与の前払い申請や年末調整の手続き、そして電子労働契約の締結までがスタッフのスマホ上で完結可能です。システム自体が多言語に対応しているため、外国人労働者を多く抱える現場でも言語の壁を感じることなく円滑に運用できます。

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jobs（株式会社テクノロジーズ）

jobsは、中小規模の人材派遣会社に最適化されたクラウド型の人材派遣管理システムです。初期費用や保守費用が一切かからず、月額3万3,000円という固定料金のみで全機能を利用できます。

スマホの打刻やオンラインでの申請ワークフロー、シフト管理を通じて現場の正確な勤怠実績を収集し、そのデータを給与計算や請求管理といったバックオフィス業務へシームレスに直結させることが可能です。システムを使い慣れていない担当者でも直感的に操作できる洗練された画面デザインを採用しており、回数無制限で無料の電話・オンラインサポートを受けられます。

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派遣会社向け勤怠管理システムの選び方

派遣会社に最適な勤怠管理システムを選ぶ際、確実に現場へ定着させるための判断基準は、主に下記3つです。

派遣先の上司が操作しやすい承認方法か

派遣先の指揮命令者が簡単に操作できるかどうか確認しましょう。「IDやパスワード管理が面倒」と敬遠されると、Webでの勤怠承認機能が使ってもらえない可能性があるからです。

ログイン不要で届いたメールから直接承認できる仕組みや、スマホ画面で素早く操作できるシステムが重宝します。タイムカードの回収遅れを防ぐためにも、事前に派遣先側の承認フローを確認し、マニュアルなしで直感的に押せるかチェックしましょう。

稼働人数に応じた柔軟な料金体系か

派遣事業は登録人数と実際の稼働人数に差が生じやすいビジネスです。「費用を安く抑えたい」と選んだシステムでも、全登録者数に対して月額が発生する仕組みでは、休職中や退職手続き中のスタッフ分まで維持費がかかります。

自社に最適な勤怠管理システムを選ぶ際、今月の打刻や申請を行った人数だけに課金される、稼働人数ベースの料金体系を備えた製品を選びましょう。派遣先の上司といった承認者アカウントの追加に追加費用が発生しないかも、あわせて確認が必要です。

利用中の給与ソフトや人材派遣管理システムと連携できるか

集計された勤怠データを、自社で利用している給与計算ソフトや人材派遣管理システムへ円滑に取り込めるか確認しましょう。CSV出力に対応していても、項目の並び順やデータ形式が合わない場合、毎月Excelで加工する手間が残ります。

自社のソフトの形式にあわせて、出力項目や並び順を自由に設定できる製品の場合、手作業での修正作業をゼロにできれば、転記ミスの防止とあわせて月末の締め作業時間を短縮できるでしょう。

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派遣会社向け勤怠管理システムの注意点

派遣会社向け勤怠管理システムを導入、または移行する際、契約面や運用面でのトラブルを避けるため、下記のポイントに注意が必要です。

派遣先の現場環境とセキュリティ制限を確認する

派遣会社向け勤怠管理システムを導入しても、派遣先によっては私物スマホの持ち込み禁止や、社内ネットワークからの外部サイト接続制限といったセキュリティルールが存在します。

スマホアプリだけでなく、PCブラウザや共有タブレットの打刻、メールでのワンタップ承認といった複数の方法を用意できる製品を選ぶことが大切です。「現場で使えない」というトラブルを防ぐため、事前に派遣先へ確認を行いましょう。

旧システムからのデータ移行時に保存期間を確保する

別の勤怠管理システムから切り替える場合、過去データの保存方法に注意が必要です。労働基準法により、勤怠記録や賃金関係のデータは数年間の保存が義務付けられており、旧システムを解約すると、過去のタイムシートや承認ログが閲覧できなくなる製品も存在します。

解約前に過去データをCSVやPDFで一括保存できるか確認し、移行計画を立てましょう。解約予告期間も踏まえ、新旧システムを並行運用する期間を設けると安心です。

本運用の前に派遣先とスタッフへの周知を行う

派遣会社向け勤怠管理システムの変更で注意が必要な点のひとつが、派遣先の承認者や派遣スタッフの操作です。「使い方が分からない」という不満からWeb承認が滞り、給与計算に影響が出る恐れがあります。

本運用を始める前に、派遣先向けの簡単な操作案内を用意し、周知を徹底しましょう。一部の派遣現場でテスト運用を行い、操作感やデータ連携に問題がないか検証すると安全です。

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