派遣会社におすすめの勤怠管理システム13選！

「派遣先ごとにタイムカードの形式がバラバラで集計に膨大な時間がかかる」「スタッフの労働時間をリアルタイムに追いきれない」こうした悩みは、多くの派遣会社が共通して抱える課題です。

派遣業務に特化した、あるいは柔軟性の高い勤怠管理システムを導入すれば、月末月初の締め作業は改善できます。加えて、残業アラート機能を活用することで、法令違反のリスクを未然に防ぐ「守りの管理」も可能です。

派遣会社が選ぶべき製品のポイントと、法令で義務付けられている管理項目を整理しながら、おすすめの勤怠管理システムについて紹介します。

派遣会社におすすめの勤怠管理システム比較表

主にスタッフの勤怠管理を対象にした派遣会社向けのシステムを導入するにあたって、費用感やワークフロー、36協定アラートといった機能が網羅できているか確かめることが大切です。

下記の製品比較表でまとめましたので、最適な勤怠管理システム選定の参考にご活用ください。

※ミツモア調べ（2026年4月現在）

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派遣会社におすすめの勤怠管理システム13選

派遣会社におすすめの勤怠管理システムについて、紹介します。

e-staffing（株式会社イー・スタッフィング）

e-staffingは、人材派遣大手3社が共同で立ち上げた勤怠管理システムです。派遣スタッフのスマホ打刻データに対し、派遣先の責任者がオンライン上で即座に承認を行える仕組みにより、リアルタイムで正確な労働時間を把握できます。

最大12年4ヶ月にわたる勤怠実績の電子保存機能を通じて法定帳票を厳密に管理することが可能です。労働時間や残業の適切な把握といったコンプライアンス体制を強力に支援します。

多数の派遣先企業と取引があり、クライアント側の新たなシステム導入ハードルを極力下げたい派遣会社におすすめします。

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e-TimeCard（株式会社イー・スタッフィング）

e-TimeCardは、初期導入費用が無料で、派遣スタッフ1名の勤怠入力につき半月当たりわずか50円で利用できる勤怠管理システムです。利用申し込みから最短3営業日で稼働できます。

派遣スタッフがスマホやPCから打刻・申請した勤怠データを、派遣先の責任者がウェブ上で即座に承認できる仕組みにより、月末のタイムシート回収の手間と郵送費用を抑えることが可能です。派遣スタッフだけでなく自社の内勤スタッフの勤怠データも同一基盤で一元管理できるため、社内全体の労務管理プロセスを統合できます。

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メッキー派遣管理（株式会社アドソフト）

メッキー派遣管理は、案件情報やスタッフ情報、給与や契約情報、勤怠情報などを一元管理できる人材派遣に特化したクラウド型の勤怠管理システムです。スマホ打刻やシフト管理を通じて収集された日々の勤怠実績は、給与や請求処理へスムーズに接続され、月末の集計ミスや手入力の負担を防止します。

AIマッチングや地図情報を活用した最適な人材提案の自動化機能も搭載しており、労務管理にとどまらず営業活動の効率化も支援します。すべての利用者が電話やウェブ会議を通じた丁寧な導入サポートを受けられるため、新たな業務フローを確実に現場へ定着させることが可能です。

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CROSS NAVI（株式会社キャムテック）

CROSS NAVIは、1日単位や30日以内の短期派遣の雇用を支援する勤怠管理システムです。人材紹介から雇用・勤怠管理に至るまでの一連の業務をシームレスにサポートし、労務管理担当者の負担を効果的に軽減します。

収集した勤怠データを基に、日払いや週払いといった柔軟な給与支払いオプションをシステム上で効率的に処理することが可能です。多様な働き方への対応と労務コストの大幅な削減を両立できるため、スポット派遣や短期の案件を主力事業とし、日々変動する数多くのスタッフの稼働管理に忙殺されている派遣会社におすすめします。

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クラウドスタッフィング（株式会社クラウドスタッフィング）

クラウドスタッフィングは、派遣先企業と派遣元企業両方で勤怠情報をリアルタイムで共有できるクラウド型勤怠管理システムです。データ通信の暗号化や不正アクセスを防止する高度なセキュリティ対策を複数備え、機密性の高い情報を安全な環境で保持します。

システムに搭載された労働時間チェッカーを活用することで、スタッフごとの詳細な稼働状況や有給休暇、深夜労働の時間を正確に追跡することが可能です。スマホ打刻で収集した勤怠データのオンライン承認ワークフローに加え、システム内の専用チャットを通じて現場との業務連絡をシームレスに行えるため、三者間で発生する確認作業や連絡の手間を大幅に削減します。

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HRstation（アルティウスリンク株式会社）

HRstationは、KDDIグループが提供する勤怠管理システムです。派遣先企業は無料で利用できるためシステム連携のハードルが極めて低く、HTTPS接続の暗号化や定期的な脆弱性診断が施されたセキュアな環境でスタッフ情報を一元管理できます。

1か月間無料でトライアルすることが可能です。スマホからの勤怠入力とオンラインでの承認ワークフローによりペーパーレス化を実現し、正確な稼働データを請求書の自動作成へと直結させます。

36協定アラート機能によりスタッフや事業所ごとの抵触日および時間外労働を詳細に追跡し、上限超過を未然に防ぐ適法な運用体制を自動で構築することも可能です。

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e-naviタイムシート派遣（株式会社イー･クリエーション）

e-naviタイムシート派遣は、初期費用0円で導入できるクラウド勤怠管理システムです。料金体系は、派遣元でスタッフ1人あたり月額250円の従量課金制を採用しています。

派遣スタッフがスマホから打刻した出退勤データを、派遣先の責任者がオンライン上で即座に承認することが可能です。一元化された勤怠データは自動で集計され、自社の給与計算や請求業務へとシームレスに反映されるため、月末に集中するタイムシートの回収や手入力の負担を削減します。

データの暗号化や厳密なアクセス制限により、セキュアな環境下で三者間の情報を統合管理することも可能です。

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DigiSheet（株式会社ヒューアップテクノロジー）

DigiSheetは、人材派遣業に特化したクラウド型の勤怠管理システムです。導入作業の段階から稼働後に至るまで専任のスタッフが対応する手厚いサポート体制が強みで、年に一度の直接訪問によるフォローアップや丁寧なレクチャーを通じて、システムの確実な定着を後押しします。

派遣スタッフによる打刻や各種申請ワークフロー、シフト管理といった日々の勤怠データをクラウド上で一元処理し、派遣先企業がオンラインでスムーズに承認できる環境を構築します。ITシステムの導入に際して、自社の内勤社員や派遣先企業の担当者から理解を得て正しく運用できるか不安を抱えている派遣会社に最適です。

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staff-one（株式会社ジェイテック）

staff-oneは、特定非営利活動法人「日本一般労働者派遣協会」の推奨を受けており、直感的な使いやすさに定評があるクラウド型のシステムです。マニュアルを熟読しなくても直感的に操作できる洗練された画面設計を採用しており、1か月間は試用版として無料で利用できます。

スマホやタブレット端末からの打刻でオンラインによる申請ワークフローやシフト管理をスムーズに行うことが可能です。収集した勤怠実績のデータから、多様な勤務形態に合わせた労働時間の自動計算が行われ、事前に登録された契約情報を基に請求書まで自動で作成されます。

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PlusNavi（ユニテックシステム株式会社）

PlusNaviは、ユニテックシステム株式会社が提供するクラウド型の勤怠管理システムです。同社の人材マッチングシステムである「キャスティングナビ」と連携させることで、スタッフの手配から日々の勤怠管理までを支援します。

スマホ打刻やオンラインの申請ワークフロー、シフト管理機能を通じて日々の正確な勤怠データを収集することが可能です。データを基にした給与明細はウェブ上でスタッフへ公開され、課税手当や非課税手当といった詳細な金額まで明示されるため、スタッフへの迅速な情報開示とバックオフィスのペーパーレス化を同時に達成します。

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スタッフナビゲーター（ユニテックシステム株式会社）

スタッフナビゲーターは、派遣社員の登録から給与支払いまでの全業務フローを一貫して管理できるクラウド型のシステムです。スマートフォン打刻やオンラインでの申請ワークフロー、シフト管理機能により正確な出退勤データを収集し、給与計算や請求管理へとスムーズに連携させます。

資格や経験だけでなくスタッフの印象や雰囲気といった定性的な情報までデータベース化し、条件に合致する人材へ業務情報をメールやSMSで一斉配信するスピードマッチング機能を搭載しているのも特徴です。

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STAFF EXPRESS（株式会社エスアイ・システム）

STAFF EXPRESSは、人材派遣、紹介、請負ビジネスにおける全業務フローをワンストップで処理する、オールインワンの人材派遣特化型システムです。GPS連携による正確な出退勤打刻によって不正を根本から防止し、オンラインの申請ワークフローを通じて残業やシフトの管理をリアルタイムで行えます。

収集された勤怠データが給与計算や請求処理へとシームレスに直結するだけでなく、給与の前払い申請や年末調整の手続き、そして電子労働契約の締結までがスタッフのスマホ上で完結可能です。システム自体が多言語に対応しているため、外国人労働者を多く抱える現場でも言語の壁を感じることなく円滑に運用できます。

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jobs（株式会社テクノロジーズ）

jobsは、中小規模の人材派遣会社に最適化されたクラウド型の人材派遣管理システムです。初期費用や保守費用が一切かからず、月額3万3,000円という固定料金のみで全機能を利用できます。

スマホの打刻やオンラインでの申請ワークフロー、シフト管理を通じて現場の正確な勤怠実績を収集し、そのデータを給与計算や請求管理といったバックオフィス業務へシームレスに直結させることが可能です。システムを使い慣れていない担当者でも直感的に操作できる洗練された画面デザインを採用しており、回数無制限で無料の電話・オンラインサポートを受けられます。

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派遣先と派遣元（自社）で異なる勤怠管理すべき項目

派遣社員の勤怠管理を行う際、労働基準法および労働者派遣法に基づき、「派遣先」と「派遣元（自社）」の双方で異なる責任と管理項目が義務付けられています。複雑な「二重管理」の構造を正確に把握しておくことが、法的リスク（コンプライアンス違反）を未然に防ぎ、自社に最適な勤怠管理システムを選定できます。

派遣先と派遣元（自社）、それぞれの立場で管理すべき項目について整理します。

派遣先企業（受け入れ先）が管理・把握すべき項目

派遣先企業は、派遣社員に対して直接的な給与支払いの義務は負いません。ただし現場における「指揮命令者」として、労働実態を正確に把握し、安全な労働環境を提供する義務（安全配慮義務）を負っています。

具体的に管理・把握すべき項目は、下記3点です。

• 日々の実労働時間と休憩時間の把握
• 時間外労働（残業）や深夜労働、休日労働の実績管理
• 安全衛生管理と過重労働の防止

派遣先企業がこれらの項目を正確に管理・報告してくれなければ、派遣元である自社は正しい給与計算も請求もできません。勤怠管理システム導入の際は、派遣先の現場担当者にとっても、負担なく正確に打刻・承認ができる機能が備わっているかどうか確認しましょう。

派遣元企業（自社）が管理・把握すべき項目

派遣社員の雇用主である派遣元企業（自社）は、労働基準法上の使用者として、給与の支払いから労務管理の全般に至るまで、法的責任を負っています。具体的に管理・把握すべき項目は、下記4点です。

• 正確な賃金支払いと給与・請求計算
• 自社の「36協定」に基づく時間外労働の上限管理
• 年次有給休暇の管理（5日以上の取得義務）
• 派遣先管理台帳への正確な記録

近年の法改正により、労働時間の客観的な把握はさらに厳格化されています

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派遣会社の勤怠管理システムを選ぶポイント

自社に最適な勤怠管理システムを選ぶ際、確実に現場へ定着させるための判断基準は、主に下記3つです。

スマホ打刻とGPS機能が搭載されているか

派遣先によって就業環境が異なるため、場所を選ばないスマホ打刻と位置情報の取得機能は不可欠です。物理的なレコーダーを全拠点に設置するのは現実的ではありません。

3G回線のサービスが完全に終了した現在、旧来の携帯電話（ガラケー）に依存したシステムからの脱却が必要です。GPS連動のスマホ打刻なら、直行直帰の現場でも「いつ、どこで」働いたかを正確に記録できます。

不正打刻を排除し、派遣先企業に対する労働記録の信頼性を飛躍的に高めることが可能です。

36協定をはじめとする労働関連法に対応しているか

複雑化する法規制から会社を守るため、最新の労働関連法に自動適応できるシステムを選びましょう。2024年の残業上限規制の適用を経て、2026年現在も労働時間の管理責任はより厳格化されています。

派遣社員の残業は、派遣元が締結した36協定の範囲内で管理しなければなりません。上限に達する前に管理者や派遣先へ自動で通知するアラート機能は、法令違反を未然に防ぐ役割を果たせます。

承認ワークフローと既存バックオフィスシステムとの連携ができるか

勤怠管理システムの導入で業務効率を最大化するためには、派遣社員・派遣先・派遣元の三者を結ぶ「オンライン承認」と、既存システムとの連携が必要です。スタッフが申請した実績を、派遣先の現場責任者がその場でデジタル承認できるワークフロー機能があれば、月末に集中する紙のタイムシート回収や確認作業を完全に消滅させられます。

確定したデータを自社の給与計算や請求システムへ「無加工」で取り込めるかを確認しましょう。このデータ連携が確立して初めて、手入力によるミスと担当者の長時間労働を削減できます。

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人材派遣管理システムを利用する選択肢

自社に登録する派遣社員の勤怠管理をおこなう手段として、人材派遣管理システムを利用する選択肢もあります。出退勤の記録だけでなく、スタッフの配置・契約管理・請求処理といった、派遣事業特有の複雑な業務を一元管理できるのが強みです。

派遣会社のバックオフィス全体の業務効率を飛躍的に高めることが期待できるため、あわせて検討してみましょう。

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