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工数管理ができる勤怠管理システム比較14選!

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最終更新日: 2026年06月05日

「出退勤はタイムカードなのに、プロジェクトごとの工数はExcelで別入力していて面倒」「勤務時間と工数データの数値がズレてしまう」従業員の作業負荷を正しく把握したいのに、二重入力の手間や入力漏れに悩んでいませんか。

工数管理機能がついた勤怠管理システムへ移行すれば、Excelデータを突き合わせる手間がなくなり、給与計算ソフトとの連携もスムーズになります。さらに、特定のメンバーへの業務過多もグラフなどで一目でわかるため、手遅れになる前に業務を再分配(タスクの調整)することが可能です。

工数管理ができる勤怠管理システムについて、導入のメリットや自社にあわせた選び方を含めて紹介します。

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工数管理ができる勤怠管理システム比較表

工数管理機能を備えた勤怠管理システム14製品の特徴を下記の比較表にまとめました。自社のシステムインフラに最適な製品の絞り込みにお役立てください。

製品名 システム区分 初期費用(税込) 月額最低料金(税込) 無料トライアル期間 カレンダー連携可否 給与計算ソフトとのAPI連携可否
TeamSpirit勤怠 統合型(ERP) 要問い合わせ 33,000円〜 要問い合わせ
WiMS/SaaS 勤務管理システム 統合型(ERP) 要問い合わせ 要問い合わせ なし(個別デモ対応等)
COMPANY 統合型(ERP) 要問い合わせ 要問い合わせ なし
ジョブカン勤怠管理 オプション型 0円 月額2,200円〜(最低料金制約、単価330円 / 名〜) 30日間 ×(外部連携ツールを介す場合を除く)
マネーフォワード クラウド勤怠Plus オプション型 要問い合わせ 要問い合わせ(工数管理は上位プランにて対応) 1ヶ月間 〇(MFクラウド給与等と連動)
楽楽勤怠 オプション型 要問い合わせ 33,000円~ 要問い合わせ 〇(要問い合わせ)
follow SaaS版 オプション型 0円 27,250円~(50アカウント分~) 最大60日間 ×
奉行Edge 勤怠管理クラウド オプション型 0円 15,400円〜(20ライセンス含む) 30日間 ×(外部連携等の対応を除く) 〇(給与奉行等と連動)
TimePro-eX オプション型 要問い合わせ 要問い合わせ なし ×
ちゃっかり勤太くん オプション型 112,200円~(工数管理の初期費用込み) 4,400円~(工数管理の月額費用込み) 30日間 ×
freee勤怠管理Plus 外部連携型 0円 月額1,650円〜(5名分)+プロジェクト管理別途 30日間 ×(シリーズ単体での直接連携) 〇(freee人事労務等と連動)
KING OF TIME 外部連携型 0円 330円 / 名 30日間 ×(工数専門の外部連携ツール側で対応)
MITERAS勤怠 外部連携型 要問い合わせ 要問い合わせ 要問い合わせ ×
CC-BizMate 外部連携型 275,000円~ 16,500円~(50ユーザ) 30日間 ×

※ミツモア調べ(2026年6月時点)

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工数管理ができる勤怠管理システム14選

標準機能として工数管理ができるシステムをはじめ、オプションで追加できる製品や、専門ソフトと連携可能なシステムまで、それぞれの特徴を詳しく紹介します。

TeamSpirit 勤怠(株式会社チームスピリット)

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出典:「TeamSpirit 勤怠」公式Webサイト

TeamSpirit 勤怠は、Salesforceプラットフォーム上で勤怠管理、工数管理、経費精算をシームレスに一体運用できるクラウド型勤怠管理システムです。出退勤実績とプロジェクトの作業時間が完全連動し、データの不整合が原理的に発生しません。

従業員はカレンダー情報からの取り込みやスライダー操作により、直感的に工数を記録できます。時間単位休暇を含む休日休暇管理も自動で集計され、確定した労働データは給与計算ソフトへシームレスに連携できるため、月次締め業務を劇的に削減すると同時に、1円単位の正確な個別原価計算をリアルタイムで可視化できるでしょう。

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WiMS/SaaS 勤務管理システム(株式会社ソリューション・アンド・テクノロジー)

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出典:「WiMS_SaaS勤怠管理システム」公式Webサイト

WiMS/SaaSは、複雑な就業規則や変形労働時間制、プロジェクトごとの工数管理にも柔軟に適応できる勤怠管理システムです。1,000名以上の大規模組織や複雑なマトリクス組織、あるいはグループ会社間での共通利用を想定した設計となっており、高度な承認ワークフローと各種基幹システム(ERP)とのシームレスな双方向データ連携を実現します。

プロジェクト別の工数管理および予実績管理機能が標準提供されているため、日々の勤務実績データと紐づいた作業時間の記録や分析ができるのがポイントです。独自性の強い就業ルールの下での休日休暇管理を正確に自動化し、確定した労働データを給与計算ソフトや上位のERPへスムーズに引き渡せます。

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COMPANY勤務管理(株式会社Works Human Intelligence)

出典:「COMPANY」公式Webサイト

COMPANY勤怠管理は、在宅勤務やフレックスタイム制、変形労働といった複雑な勤務形態にも対応できるシステムです。大手特有の複雑な人事制度や出向、兼務といった特殊な要件に対し、個別の追加開発を行うことなく、ノーカスタマイズで柔軟に適応できます。

工数管理機能は、単なるプロジェクトごとの収支算出に留まらず、人事評価データやタレントマネジメントの基盤としても連動可能です。業務内容別の生産性分析を多角的に実行できます。

休日休暇管理や複雑なシフト管理も自動化され、確定した労働データは同シリーズの給与計算システムへとシームレスに連携できるのもポイントです。法改正やトレンドに伴う定周期のバージョンアップが無償で行われます。

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ジョブカン勤怠管理(株式会社DONUTS)

出典:「ジョブカン勤怠管理」公式Webサイト

ジョブカン勤怠管理は、株式会社DONUTSが提供するクラウド型の勤怠管理システムです。出勤管理や休暇管理など、自社の組織規模や管理レベルに合わせて必要な機能を選択できます。

工数管理機能は月額プラス110円の追加モジュールとして利用可能です。近年のリニューアルによってプロジェクトや部署といった独自の分類項目を掛け合わせた詳細な分析や、円グラフ・棒グラフによる自動データ可視化機能が大幅に強化されました。

細かな閲覧権限設定により、入力者と管理者の役割を適切に割り振ることも容易です。さらに、確定した労働データは給与計算ソフトへシームレスに連携でき、休日休暇管理の自動化も同時に実現します。

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マネーフォワード クラウド勤怠Plus(株式会社マネーフォワード)

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出典:「マネーフォワード クラウド勤怠Plus」公式Webサイト

マネーフォワード クラウド勤怠Plusは、あらゆる業種、規模、複雑な就業ルールにフィットする高度なクラウド勤怠管理システムです。バックオフィス全体のシームレスなデータ連携に強みがあり、マニュアル不要で使える洗練されたUI/UXを搭載しています。

工数管理機能においては、従業員が日々のプロジェクトやタスクの稼働時間を簡単に入力でき、登録されたデータはシステム上で即座に自動でグラフ化できるのが特徴です。これにより、誰がどの業務にどれだけリソースを割いているかを視覚的に素早く把握できるでしょう。

時間単位休暇を含む休日休暇管理や複雑な就業規則の自動集計にも柔軟に対応しており、確定した労働データは同シリーズの給与計算ソフトへ手作業の転記なしでシームレスに流し込むことができます。

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楽楽勤怠(株式会社ラクス)

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出典:「楽楽勤怠」公式Webサイト

楽楽勤怠は、豊富な機能と高いカスタマイズ性を兼ね備えた勤怠管理システムです。スマホの打刻にも標準対応しているため、直行直帰やテレワークが混在する環境でも勤務実態を正確にトラッキングできます。

工数管理機能においては、勤怠データと同じシステム内でプロジェクトやタスクごとの稼働時間を入力・集計できるため、効率的なプロジェクト運営が可能です。登録された工数実績に従業員ごとの目安単価を掛け合わせることで想定人件費を即座に算出できるだけでなく、1日の総実労働時間と入力されたプロジェクト工数との間に乖離がないかを確かめる「差分チェック機能」を搭載しています。

休日休暇管理では有給休暇の自動付与や残日数、消滅期限の可視化がワン画面で完結可能です。給与システムとの連携性も高く、自社で利用中の給与計算ソフトのレイアウトに合わせたCSVデータを柔軟に出力できるため、月末のデータ集計や転記にかかる手間を軽減できるでしょう。

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follow SaaS版(NTTドコモソリューションズ株式会社)

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出典:「follow SaaS版」公式Webサイト

follow SaaS版は、NTTドコモグループが提供する、高い信頼性とシンプルさを兼ね備えたクラウド型勤怠管理システムです。スマホやタブレットからの打刻や申請に標準対応しています。

工数管理オプションを追加することで、日々の勤務実績データとシームレスに紐づいた作業時間の記録や分析が可能です。過度な複雑さを排除した直感的な設計のため現場が迷わず入力でき、有給休暇の自動付与などの休日休暇管理や、多様な勤務体系の集計もスムーズに自動化できます。

確定した正確な労働データは、そのまま給与計算ソフトへシームレスに連携でき、毎月のバックオフィス業務の負担を減らせるでしょう。

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奉行Edge 勤怠管理クラウド(株式会社オービックビジネスコンサルタント)

出典:「奉行Edge勤怠管理クラウド」公式Webサイト

奉行Edge 勤怠管理クラウドは、複雑な就業規則や多様な勤務体系への対応力に定評があるクラウド型勤怠管理システムです。専用の工数管理オプションを追加することで、日々の出退勤記録とプロジェクトの作業時間をスムーズに紐づけられます

入力漏れを検知する強力なアラート機能を搭載しており、データの形骸化を防いで正確な労務費を算出することが可能です。休日休暇管理では有給休暇の自動付与や消化状況を確実に一元管理できます。

確定データは同シリーズの給与奉行や勘定奉行とネイティブに連動するため、給与計算や原価計算への流し込みを自動化し、月末の処理を効率化します。

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TimePro-eX(アマノ株式会社)

TimeProEX
出典:「TimePro-eX」公式Webサイト

TimePro-eXは、アマノ株式会社が提供する労務管理ノウハウが凝縮された勤怠管理システムです。製造業や多拠点展開企業に見られる非常に複雑なシフト作成や就業形態の管理に対応しつつ、それに伴う日々の工数実績を正確かつ堅牢に一元管理できる仕組みを備えています

作業時間の記録が実労働時間と直結して集計されるため、データの不整合を未然に防ぎ、個別原価計算の精度を向上することが可能です。有給休暇の自動付与や消化状況を確実に可視化する休日休暇管理機能も標準搭載しています。

確定した労働データは主要な給与計算ソフトへスムーズに引き渡せるため、月末の集計作業や手作業による転記ミスを完全に撤廃し、バックオフィス全体の業務効率化に役立つでしょう。

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ちゃっかり勤太くん(株式会社エイ・アイ・エス)

出典:「ちゃっかり勤太くん」公式Webサイト

ちゃっかり勤太くんは、現場主導で必要な機能を柔軟に組み上げることができる、カスタマイズ性に優れた就業管理システムです。工数管理機能においては、現場の実情に合わせた詳細な入力項目の設定が可能で、リアルタイムでの損益管理と正確な作業報告を実現します

変形労働時間制や複雑なシフトパターンに標準対応しているため、日々の勤務実績データとプロジェクト別の作業時間を正確に連動させることが可能です。有給休暇の自動付与や取得状況を可視化する休日休暇管理機能も備わっており、確定した労働データは主要な給与計算ソフトへシームレスに引き渡せるため、月末のデータ集計や転記にかかる手間を大幅に削減します。

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freee 勤怠管理 Plus(フリー株式会社)

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出典:「freee勤怠管理Plus」公式Webサイト

freee(フリー)勤怠管理Plusは、事前準備から締め作業まですべての作業をクラウドで一元化できる勤怠管理システムです。「freee工数管理」とAPIによる連携をすることで、勤怠実績のデータが自動的に取り込まれ、毎日の総労働時間とプロジェクト工数の合計を簡単に一致させられます

休日休暇管理においては、有休や代休の半休取得、各種アラート機能による取得促進まで柔軟に対応しているのがポイントです。給与計算においては、確定した勤怠実績が手打ちの手間なく自動で給与ソフトへ流し込まれ、複雑な割増賃金の計算から給与明細の発行まで一気通貫で行えます。

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KING of TIME(株式会社ヒューマンテクノロジーズ)

出典:「KING OF TIME」公式Webサイト

KING OF TIME(キングオブタイム)は、月額330円/名という低価格ながら、給与計算システムとの連携機能を備えたクラウド型勤怠管理システムです。標準機能の「補助項目」を活用することで、プロジェクトごとの作業時間や任意の集計項目を従業員画面から手軽に記録・申請できます

PCやモバイル端末から時間帯や時間数を直接登録できるため、直行直帰の環境でも現場に負担をかけずにデータを蓄積可能です。有給休暇の自動付与を行う休日休暇管理機能も備わっており、確定した労働データは利用中の給与計算ソフトのレイアウトに合わせて柔軟に出力できるため、月末の転記作業や手作業のミスを抑えられます。

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MITERAS勤怠(パーソルビジネスプロセスデザイン株式会社)

出典:「MITERAS勤怠」公式Webサイト

MITERAS勤怠は、労務コンプライアンスの遵守と実態把握に特化したクラウド型就業管理システムです。PCのログオンおよびログオフの客観的な記録を自動収集し、従業員の勤怠打刻データや工数入力の実績と突き合わせる独自の強力な機能を備えています。

工数管理機能においては、プロジェクトごとの従事時間を記録できるだけでなく、PCの稼働ログとの間に乖離が検知された場合にシステムが自動でアラートを発出するのが特徴です。不正確な工数入力を防止し、精度の高い個別原価計算を可能にします。

有給休暇の自動付与などの休日休暇管理機能も網羅されており、確定した正しい労働データは主要な給与計算ソフトへシームレスに連携できるのもポイントです。

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CC-BizMate (株式会社クロスキャット)

出典:「CC-Bizmate」公式Webサイト

CC-BizMateは、TODOリストとアラート機能を搭載し、人事業務を効率化する勤怠管理システムです。独自の工数およびパフォーマンス分析機能である「Performance Finder」を搭載しており、誰がいつ何をしていたかを細かく分析し、業務内容別の生産性推移を可視化できます

単なる時間の記録に留まらず、業務プロセスの可視化からその成果を人事評価へと連動させる高度な仕組みを備えている点が大きな強みです。休日休暇管理の自動化や、確定した正確な労働データを給与計算ソフトへスムーズに引き渡せる基本機能も網羅しているため、月末の集計作業にかかる手間を削減できます。

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勤怠管理システムをもっと比較したい方はこちら▶勤怠管理システム比較45選!おすすめ製品を最短1分で自動診断|ミツモア

工数管理ができる勤怠管理システムを導入するメリット

工数管理機能がついた勤怠管理システムを導入するメリットは、主に以下の2点です。

プロジェクトごとの売上原価が可視化できる

工数管理ができる勤怠管理システムを導入・乗り換えをすることで、プロジェクトごとの売上原価をほぼリアルタイムに把握できるようになり、最終的な営業利益の向上に直結するでしょう

出退勤の記録とプロジェクトごとの稼働実績がシステム上で連動するため、不採算案件の早期是正や人員配置の最適化がタイムリーに行えるようになります。「人」が原価となるプロジェクト型ビジネスにおいて、リアルタイムな原価管理は経営を支える強力な武器になるでしょう。

管理者側のタイムマネジメント意識を向上させる

工数管理機能が搭載された勤怠管理システムに移行すると、管理者は従業員のタイムマネジメントに対する意識を高め、組織的な過重労働を防げます

蓄積されたデータを単なる「時間の監視」として使うのではなく、適切なリソース配分や正当な評価のために活用するという目的が明確になるためです。システムを通じて現場の就業環境をダイレクトに改善していくことは、従業員のエンゲージメントを高め、健全な社内カルチャーを育てることにもつながります。

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工数管理ができる勤怠管理システム導入時の注意点

工数管理機能がついた勤怠管理システムを導入する際は、下記2点に注意が必要です。

労働時間とプロジェクト作業時間は本質的に一致しない

工数管理ができる勤怠管理システムの導入時に注意すべき点は、出退勤の「労働時間」とプロジェクトの「作業時間」を完全に一致させようと強制することです。実務において、この2つのデータは目的も性質も根本的に異なっています。

1日の勤務時間中には、特定のプロジェクトに割り振るのが難しい雑務が発生する場合もあり、これらを無理に完全一致させようとすると、従業員は月末の締め日に辻褄(つじつま)を合わせるためだけに、実態とは異なる適当な数値を入力するようになってしまいます。

原価計算の信頼性が落ちてしまうため、あらかじめ「共通業務」や「雑務」といった受け皿となる項目(マスタ)を用意するなど、運用に余裕を持たせることが大切です。

プロジェクトの進捗管理や予実分析における機能的な限界がある

工数管理ができる勤怠管理システムを検討する際は、ツールが持つ機能の限界を正しく認識しておく必要があります。一般的な勤怠システムに備わっている工数管理機能は、あくまで労働時間の配分とそれに基づく労務費の集計(原価計算への連動)に特化しているためです。

次のような高度なプロジェクトマネジメント機能までは網羅できないケースがほとんどです。

  • ガントチャートによるリアルタイムな進捗の可視化
  • 詳細なタスクごとの予算・実績管理(予実分析)
  • クライアントへの詳細な工数報告

主な業務内容が現場の生産性向上や高度な収益分析、進捗管理を主な目的とする場合、勤怠システム単体での一元化にこだわらず、カレンダー連携などに優れた工数管理の専門ツールを外部連携させる柔軟な設計も視野に入れるべきです。

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工数管理ができる勤怠管理システムの選び方

工数管理機能がついた勤怠管理システムを選ぶ際は、以下5つのポイントを踏まえて、自社の目的に最も合う製品を見極めることが大切です。

勤怠管理システムと工数管理を組み合わせるやり方が決まっているか

自社の管理目的によって、主に以下の3つのアプローチ(タイプ)に分かれます。

統合型(ERP型)

勤怠、工数、経費精算などを一つのデータベースで一元管理するスタイルです。出退勤データと作業時間が完全に連動するためデータのズレが起きず、リアルタイムで正確なプロジェクト損益を可視化できます。

オプション機能型

標準的な勤怠システムに工数入力を追加するスタイルです。同じシステム内で完結するためマスタ管理の手間が少なく、低コストでスモールスタートを切りたい組織に向いています。

外部連携型(API連携型)

既存の勤怠システムに、工数管理の専門ツールをAPIで接続するスタイルです。現場が使い慣れた画面や、職種特化型の高機能なプロジェクト管理ツールをそのまま活かせるため、導入時の混乱を最小限に抑えられます。

就業規則と複雑な勤務体系に対応できるか

プロジェクト型ビジネスでは、フレックスタイム制や裁量労働制など、多様な勤務体系が採用されることが多いため、システムの柔軟性が不可欠です。複雑な労働時間が正しく自動集計されないと、手動での修正作業が常態化し、管理部門の負担が増えてしまいます。

特に、法的な休暇取得要件や多様な働き方への対応をクリアするためには、システムが正確に勤務実態を記録できることが前提です。自社の特殊な就業規則を、標準機能やカスタマイズでカバーできるか必ず検証しましょう

現場の入力負荷を軽減するインターフェースを備えているか

どれほど多機能なシステムでも、入力が面倒だと遅延やデータの形骸化が発生します。従業員が毎日ストレスなく入力できるかが、選定の重要な分かれ目です。

具体的には、GoogleカレンダーやOutlookの予定をドラッグ&ドロップで同期できる機能や、スマホアプリ対応、直感的に操作できるUIがあるかを確認しましょう。無料トライアルの際は、管理担当者だけでなく現場の社員にも操作してもらい、日常業務の中で無理なく続けられるかを評価することが定着への近道です。

勤怠と工数データの整合性を取れるか

自社が求める管理会計やガバナンスのレベルに合わせて、2つのデータの整合性をどのレベルで制御するかを決定する必要があります。会計システムと連携して厳密なプロジェクト別損益を出し、IPO審査を乗り越えたい場合は、システム上で労働時間と工数の総和が完全に一致するようエラー制御を行う統合型が不可欠です。

一方で、まずは業務改善のために大まかなリソース配分や稼働トレンドを知りたいときは、打刻漏れや大きなズレを検知して促すアラート型の制御のほうが、現場の負担を抑えられるでしょう。

直近の法改正に伴うレポート出力機能が搭載しているのか

2026年に施行された「改正育児・介護休業法」により、企業には子の看護等休暇の時間単位取得や、300人超の企業における男性の育休取得割合の公表、柔軟な働き方の措置義務などが厳格に課されています。

複雑な勤務形態のレポートをワンクリックで出力し、監査証跡(証明書類)として提示できる機能は、法令違反リスクを防ぐための生命線です。蓄積したデータを単なる記録で終わらせず、法適合の証明や社内の生産性分析に即座に活かせるレポート機能があるかを確認しましょう。

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