「授業や部活動で業務が多岐にわたり、実態を把握しにくい」「宿直や日直の複雑なシフトで月末の集計が終わらない」こうした悩みを抱える学校法人の経営層や事務職員は少なくありません。
学校特有の勤務形態に合うシステムを導入すれば、残業時間を正確に記録することが可能です。客観的なデータをもとにした適切な人員配置ができ、打刻とあわせた自動集計で、事務負担も軽減できます。
学校向けの勤怠管理システムについて、導入メリットや選び方を含めて紹介します。
最終更新日: 2026年04月24日
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学校向け勤怠管理システムの比較表
学校現場での導入実績がある主要な勤怠管理システムの比較表は、以下のとおりです。教員の働き方改革において重要となる「変形労働時間制の自動計算」や「部活動時間の抽出」といった項目に焦点を当てています。
| 製品名 | 初期費用（税込） | 月額費用（税込） | 無料トライアル | 変形労働自動計算 | 部活動時間の抽出 | 36協定アラート |
|---|---|---|---|---|---|---|
| イーキューブスクール | 要問い合わせ | 要問い合わせ | 要問い合わせ | ◯ | ◯（標準搭載） | ◯ |
| 勤怠先生 | 要問い合わせ | 要問い合わせ | 要問い合わせ | ◯ | ◯（項目設定可） | ◯ |
| アトレコ | 要問い合わせ | 要問い合わせ | 要問い合わせ | ◯ | ◯（項目設定可） | ◯ |
| パソコンで勤怠管理School | 11,000円〜 | 0円 | 要問い合わせ | ◯ | △（打刻記録可） | ◯ |
| SchoolTimeReco | 要問い合わせ | 2,200円（年額26,400円） | 要問い合わせ | ◯ | ◯（標準搭載） | ◯ |
| ジンジャー勤怠 | 要問い合わせ | 330円〜/名 | １ヵ月間 | ◯ | ◯（設定で対応） | ◯ |
| MOT勤怠管理 | 34,650円〜 | 4,378円〜（20名まで） | 要問い合わせ | ◯ | ◯（設定で対応） | ◯ |
| 楽楽勤怠 | 要問い合わせ | 33,000円〜 | 要問い合わせ | ◯ | ◯（設定で対応） | ◯ |
| ジョブカン勤怠管理 | 0円 | 2,200円〜 | 30日間 | ◯ | ◯（設定で対応） | ◯ |
| KING OF TIME | 0円 | 330円/名 | 30日間 | ◯ | ◯（設定で対応） | ◯ |
| Touch On Time | 0円 | 330円/名 | 30日間 | ◯ | ◯（設定で対応） | ◯ |
| HRMOS勤怠 | 0円 | 110円/名（30名以下無料） | 1ヵ月間 | ◯ | ◯（設定で対応） | ◯ |
| マネーフォワード クラウド勤怠Plus | 要問い合わせ | 要問い合わせ | 1ヵ月間 | ◯ | ◯（設定で対応） | ◯ |
| TimePro-VG | 要問い合わせ | 要問い合わせ | 要問い合わせ | ◯ | ◯（高度な設定可） | ◯ |
| TimeBiz | 13,200円〜 | 15,840円〜 | 60日間 | ◯ | △（設定で対応） | ◯ |
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※料金・仕様は2026年時点の調査結果および公式情報を基にした推定・標準価格です。規模や契約形態により変動するため、詳細は必ず各社へお問い合わせください。
学校向けの勤怠管理システムを導入するメリット
学校現場に特化した勤怠管理システムを導入するメリットは、事務負担の軽減や法的なリスクを回避できる点で、下記3つです。
変形労働時間制に自動で対応できる
学校運営に欠かせない、1年単位の変形労働時間制を自動化できる点です。夏休みなどの閑散期と、学期末の繁忙期で労働時間が大きく異なるため、年間を通じた精緻な配分が欠かせません。
手作業やエクセルでの管理は、常に法定枠内かを確認し続ける必要があり、事務担当者の負担は極めて重くなります。勤怠管理システムを導入することで、設定した勤務カレンダーをもとに打刻データを自動集計可能です。
枠内での過不足もリアルタイムで算出するため、計算ミスによる法違反を防ぎ、工数を大幅に削減できます。
放課後や休日出勤の可視化で長時間労働を抑制できる
教員の放課後や休日の業務を数値化し、過労死ラインを超える前に対策を打つことが可能です。勤怠管理システムには、設定時間を超えそうな教員と管理職へ自動でアラートを通知する機能があります。
教頭や副校長といった学校の管理職は、月の途中で誰がどの業務で過重労働になっているのか把握でき、具体的な業務の振り分けや指導の調整につなげることが可能です。データの可視化は、教員の健康を守り、休職者を減らすための重要な判断材料になります。
学校外での勤務でも正確な打刻ができる
部活動の遠征や修学旅行といった校舎外での勤務も、正確な記録を残せます。従来の紙の出勤簿やタイムカードでは自己申告に頼らざるを得ず、これが労働時間の過少申告を招く原因でした。
スマホのGPS連携機能を活用すれば、打刻場所の位置情報と時間をセットで記録でき、文部科学省が求める客観的な記録としての証拠を残すことが可能です。
2026年4月に施行された改正給特法において、学校に対する働き方改革の計画策定や、実施状況の公表義務づけにも対応でき、事務負担の軽減とコンプライアンス強化に直結します。
学校向けの勤怠管理システムおすすめ15選
数ある勤怠管理システムの中から、学校特有の複雑な勤務形態に対応し、かつ事務負担を軽減できる12製品を紹介します。
イーキューブスクール勤怠管理システム（株式会社システムリサーチ）
イーキューブスクール勤怠管理システムは、教員の働き方改革を推進するために開発された学校専用の勤怠管理システムです。タイムレコーダーやパソコン、スマホなど8つの打刻方法を提供しており、非接触型カードなどの便利な機器を活用して、正確で客観的な出退勤時間を記録できます。
管理職にとっての最大のメリットは、標準設定で「部活動」「教材研究」「持ち帰り仕事」といった学校独自の業務項目が用意されている点です。どの業務にどれだけの時間が費やされているかを即座に可視化し、教育委員会への報告資料も自動生成できます。
改正給特法が定める時間外在校等時間の基準（月45時間など）に合わせ、超過しそうな教員をリアルタイムでリストアップするアラート機能を備えています。
勤怠先生（株式会社アットシステム）
勤怠先生は、直感的な操作性と柔軟な管理機能を両立させた、学校の校務効率化に特化した勤怠管理システムです。教職員が迷わず使えるシンプルなユーザーインターフェースを維持しながら、バックエンドでは高度な労働時間集計を実現しています。
残業や有給休暇、打刻修正など、各種申請と承認をオンラインで完結させる「ペーパーレス化」の機能が搭載されているのがポイントです。各種申請が、教員と管理職の間でスムーズに完結し、そのデータが自動的に1年単位の変形労働時間制の計算に反映されます。
労働基準監督署への提出を想定したCSVやPDFの自動出力機能も備えており、万が一の監査時にも迅速かつ正確なエビデンスを提示することが可能です。
アトレコ（アクモス株式会社）
アトレコは、学校ごとの独自の就業規則や複雑な勤務体系を、高いカスタマイズ性で再現することに長けた公立学校向けの勤怠管理システムです。学校ごとに異なる勤務形態に合わせた勤怠ルールを自由に設定できます。
特筆すべき機能は、雇用形態に応じた「勤務カレンダー」の自由な作成能力です。常勤教員から非常勤講師、嘱託職員まで、職種ごとに異なる変形労働時間制のルールを一つのシステム内で完璧に再現できます。
管理画面では、部活動や課外授業による変則的な勤務時間がリアルタイムで反映されるため、校長や教頭は月途中の段階で確実なラインケアを実行することが可能です。
ソコンで勤怠管理School（株式会社デネット）
パソコンで勤怠管理Schoolは、教員の働き方改革に特化して設計された、導入コストを極限まで抑えられるインストール型の勤怠管理システムです。インターネット接続が不要なため、教員の個人情報を内部で安全に管理できます。
月額費用はかからず、1万1,000円からの初期費用のみで、ICカード打刻による自動集計や変形労働時間制への対応ができるのがポイントです。打刻漏れや遅い退勤時間を一目で把握できるアラート機能も搭載されており、管理者は最小限の操作で教職員の勤務実態を監視・修正できます。
既存の交通系ICカードをそのまま利用できるため、予算が限られている小規模な私立校や、個人情報をクラウド上に保存することに慎重な自治体、月々の費用を抑えたい学校法人に最適です。
SchoolTimeReco（株式会社NS・コンピュータサービス）
SchoolTimeRecoは、ICカードやログイン認証を利用して教職員の出退校時間を簡単に打刻・記録するクラウド型勤怠管理システムです。1校あたり年額2万6,400円で利用でき、出退勤管理やデータ出力、マスタ管理などの機能が搭載されています。
主なポイントは、時間外勤務の「見える化」に特化したダッシュボードです。集計結果が自動的にグラフ化されるため、数値だけでは読み取りにくい教員の疲弊状況を直感的に把握できます。
職員室の入り口に設置したICカードリーダーにカードをかざす、あるいは自席でワンクリックするだけの簡便な打刻フローは、多忙な教員の打刻忘れを最小限に抑え、管理側のデータ修正工数を削減できるでしょう。
ジンジャー勤怠（jinjer株式会社）
ジンジャー勤怠は、jinjer株式会社が提供するクラウド型勤怠管理システムです。教職員の労働時間管理からコンプライアンス遵守まで、人事労務領域をトータルでサポートしています。
強みになるポイントは、教員や事務職員といった異なる「雇用形態・職種」が混在する環境下でも、それぞれのルールに沿った変形労働時間制を一元管理できる点です。スマホアプリからの申請・承認フローが完結しており、校務の合間や移動中でも迅速な承認業務ができます。
外国人教員が在籍する学校でもスムーズに運用できる多言語対応機能もあり、AIチャットによる24時間体制のサポートが、管理側の運用ストレスを最小限に抑えられるでしょう。
MOT勤怠管理（株式会社バルテックITソリューションズ）
MOT勤怠管理は、校内での勤務だけでなく、出張やテレワークといった多様な働き方にも柔軟に対応できる拡張性を備えた勤怠管理システムです。スマホアプリやGPS、顔認証など、場所を選ばない多彩な打刻手段を強みとしています。
学校管理者向けで強みとなるポイントは、部活動や校外学習による勤務時間をGPS連携で正確に記録できる点です。打刻場所の位置情報がリアルタイムで記録されるため、文部科学省が推奨する客観的な記録を容易に担保できます。
打刻漏れや長時間労働の兆候を検知すると、メールやチャットで本人と管理職へ自動でアラートを通知する機能もあり、事後処理ではなく予防的な労務管理も可能です。教員や事務職員、非常勤講師といった異なる雇用形態を一元管理し、給与計算ソフトとのスムーズなCSVデータ連携にも対応しています。
楽楽勤怠（株式会社ラクス）
楽楽勤怠は、豊富な機能と高いカスタマイズ性を兼ね備えた勤怠管理システムです。労働法に精通した専任チームが導入から運用までを並走し、学校特有の複雑な勤務ルールをいかにシステムへ落とし込むかを具体的に提案します。
誰が、いつ、どれだけの残業をしているか、ダッシュボードのグラフやカラーラベルで可視化できるのがポイントです。教頭や副校長といった管理職は、マニュアルを読み込むことなく即座に現状を把握し、部活動の調整などの具体的な指示を出せます。
1年単位の変形労働時間制の自動計算も標準搭載されており、事務担当者が手作業で数値を突合する作業も軽減できるでしょう。
ジョブカン勤怠管理（株式会社DONUTS）
ジョブカン勤怠管理は、株式会社DONUTSが提供するクラウド型の勤怠管理システムです。学校現場でも柔軟に対応でき、最新の労働法制に合わせてアップデートされるクラウド型の強みを活かして、改正給特法や36協定への準拠を強力にサポートします。
主な強みは、変形労働時間制における「設定の自由度」です。私立学校などの給与計算連携を重視する層に向け、勤怠データから給与計算までをシリーズ製品で一気通貫に自動化できます。
顔認証やGPS打刻など多様な打刻手段を選択できるため、部活動の遠征や校外学習の多い教員の労働時間も、客観性の高いデータとして正確に抽出可能です。
KING of TIME（株式会社ヒューマンテクノロジーズ）
KING OF TIME(キングオブタイム)は、月額330円/名という低価格ながら、給与計算システムとの連携機能を備えたクラウド型勤怠管理システムです。20種類以上の多彩な打刻手段と、学校を含むあらゆる業種の複雑な就業規則にも対応できます。
学校向けで強みになるポイントは、部活動や研修といった校外活動を正確に記録できるGPS打刻機能です。打刻時の位置情報が記録されるため、文部科学省が求める「客観的記録」としての証拠能力を強固に担保できます。
36協定に基づいた多段階のアラート設定も可能です。長時間労働が深刻化する前に管理職へ通知を飛ばすなど、予防的な労務管理をシステムが自動で実行します。
Touch On Time（株式会社デジジャパン）
Touch On Time（タッチオンタイム）は、専用の打刻端末を使った勤怠管理システムです。独自の高性能タイムレコーダーにより、ICカードや生体認証、パスワードという3つの打刻方法を1台で実現できます。
学校に導入するメリットは、複雑なシフト勤務や1年単位の変形労働時間制への高い適応力です。職種ごとに異なる休憩時間や休日設定を詳細に反映できるため、集計ミスによる法令違反のリスクを最小限に抑えられます。
初期費用が無料で、1人あたり月額330円という定額制は予算管理がしやすく、追加費用なしですべての機能を利用することが可能です。指紋や指静脈による高度な生体認証を活用すれば、客観性の高いデータを蓄積でき、2026年以降の厳格な労働管理義務にも余裕を持って対応できます。
HRMOS（ハーモス）勤怠 （株式会社ビズリーチ）
HRMOS(ハーモス)勤怠は、株式会社ビズリーチが提供するクラウド型勤怠管理システムです。洗練されたUIが特徴で、利用職員数30名以下の場合は無料で全機能を利用できます。
学校法人や公立学校の導入で注目するのは、勤怠状況を多角的に分析できる高度なレポート機能です。日次・月次での勤務実態をビジュアル化し、特定の教員に業務が偏っていないかを瞬時に判別できます。
SlackやLINEなどの使い慣れたチャットツールから打刻・申請ができるため、若手教員を中心に高い定着率を維持することが可能です。セキュリティ面でも2段階認証やIPアクセス制限を備えており、校内の重要情報を安全に守りながら、効率的な1年単位の変形労働制の運用を可能にします。
マネーフォワード クラウド勤怠Plus（株式会社マネーフォワード）
マネーフォワード クラウド勤怠Plusは、あらゆる業種、規模、複雑な就業ルールにフィットする高度なクラウド勤怠管理システムです。正給特法や働き方改革関連法に完全準拠しており、法改正に伴う設定変更の手間がかかりません。
3ヵ月単位までの清算期間を設定できるのが、学校に導入するメリットのひとつです。長期休業期間を跨いだ労働時間の調整が容易になり、自動集計されたデータは即座に給与計算ソフトへ連携されるため、私立学校における毎月の給与確定業務をスピーディーにできます。
アラート機能も充実しており、法定外残業が発生する前に管理職に知らせることで、事後処理ではなく事前対策としての労務管理を実現できるでしょう。
TimePro-VG（アマノ株式会社）
TimePro-VGは、柔軟性に優れ、業種や企業規模に関係なく、さまざまな就業規則や働き方に対応できる勤怠管理システムです。学校現場のあらゆる例外事項に対応でき、活動指導員と教員の兼務管理や、複数の自治体ルールを跨ぐような大規模な管理も、一つのプラットフォームで淀みなく実行できます。
ダッシュボードでは、36協定や改正給特法に準拠した詳細なアラートがリアルタイムで更新されます。管理職は法的リスクを「ゼロ」にするための確実なエビデンスを常に手元に置けるでしょう。
妥協のない法令遵守と、あらゆる勤務パターンの自動化を求める大規模な学校法人や、信頼性と安定性を最優先する自治体の教育委員会に最適なシステムです。
TimeBiz（株式会社ASJ）
TimeBiz(タイムビズ)は、勤怠管理に加えてメッセージ機能やスケジュール共有、タスク管理などを統合したグループウェア型の勤怠管理システムです。出退勤の記録だけでなく、教職員間の連絡や情報共有といった校内コミュニケーションまでデジタル化し、学校全体のDXを推進できます。
学校の管理者にとってのメリットは、最大200名まで利用可能なプランを月額1万5,840円から一元管理できる点です。1人あたりの単価に換算すると月額100円を下回る費用を実現します。
機能面においても、1年単位の変形労働時間制に対応した柔軟なシフト設定ができ、36協定の遵守をサポートするアラート機能も標準搭載されています。スマホのGPS打刻機能を活用すれば、部活動の引率や修学旅行といった校外業務も客観的な記録として正確に抽出でき、改正給特法への対応も可能です。
| 勤怠管理システムをもっと比較したい方はこちら▶勤怠管理システム比較43選！おすすめ製品を最短1分で自動診断｜ミツモア |
学校向けの勤怠管理システムの選び方
学校向けシステムを選ぶ際は、特有の複雑な運用を標準機能でどこまでカバーできるか確認しましょう。具体的には、下記5点です。
部活動や校外学習に対応する多様な打刻手段があるか
学校業務は職員室の中だけで完結しません。場所を問わず客観的な記録を残せる、多様な打刻手段が必要です。
部活動の引率や修学旅行といった校外勤務は、従来のタイムカードでは自己申告になりがち。これは、2026年4月に本格施行される改正給特法が求める客観的な把握を妨げる要因です。
スマホのGPS打刻やICカード、PCのログ取得を組み合わせられる勤怠管理システムを選びましょう。位置情報を同時に記録できれば、改ざんのない証拠として機能します。
1年単位の変形労働時間制の集計に自動対応しているか
夏休みの長期休業と学期末の繁忙期で調整する、1年単位の変形労働時間制に標準機能で対応しているか確認しましょう。制度の適切な運用には、年間の労働時間を細かく計算し、法定枠を超えないよう監視し続ける必要があります。
勤怠管理システムを導入すれば、勤務カレンダーを設定するだけで過不足を自動で算出することが可能です。超過しそうなときはアラートで警告するため、複雑な集計をシステムに任せれば、事務担当者は法的な確認作業の時間を軽減できるでしょう。
教員と事務職員で異なる雇用形態を一元管理できるか
常勤教員や非常勤講師、事務職員といった多様な雇用形態を一元管理できる柔軟性が求められます。職種ごとに就業規則や休憩ルールが異なるため、個別に設定できる機能は必須です。
外部の部活動指導員と、教職調整額が適用される公立校の教員では、管理項目の性質が根本から異なります。学校全体のコンプライアンスを強化させるためにも、全職種の状況を同一プラットフォームで統合管理できる製品を選びましょう。
教育委員会や理事会への報告用データが抽出できるか
勤怠管理の成果は、教育委員会や理事会へ提出する報告データの精度と作成スピードに現れます。文部科学省の指針や各自治体のフォーマットにあわせたレポートを、少ない工数で出力できるかが選定のポイントです。
是正勧告対策や予算獲得の根拠となるデータには、客観的な内訳が求められます。部活動や授業準備といった業務別の時間配分をグラフ化し、指定形式で抽出できる機能があれば、事務作業は劇的に効率化されるでしょう。
システムのダッシュボードが見やすいか
学校向け勤怠管理システム導入後の運用を左右するのは、管理職が日々目にするダッシュボード（管理画面）の視認性です。情報の密度が高すぎたり操作が複雑だったりすると、校長や教頭が過重労働を察知できません。
実績の多いシステムは、長時間労働の兆候がある職員を赤字で強調したり、残業時間をグラフで可視化したりと、一目で状況を判別することが可能です。2026年以降、管理職には数値の把握だけでなく、それにもとづいたラインケアが法律上の義務として課されます。
直感的に状況を把握できる画面は、教職員の健康を守るための迅速な意思決定を強力に支えます。
ぴったりの勤怠管理システム選びはミツモアで
勤怠管理システムは製品によって特徴や機能もさまざま。「どの製品を選べばいいかわからない・・・」といった方も多いのではないでしょうか。
そんなときはミツモアにおまかせ。最短1分の自動診断で、ぴったりの勤怠管理システムが見つかります。
ぴったりの勤怠管理システムを最短1分で無料診断
従業員数や欲しい機能などの項目を画面上で選択するだけで、最適な勤怠管理システムを最短1分で自動診断。もちろん費用はかかりません。
ぴったりの料金プランも一緒にお届け
希望条件に沿った料金プランも製品と一緒に診断します。概算金額を見積もりからチェックして、理想のプランを探してみましょう。
診断結果は最大5製品！比較・検討で最適な勤怠管理システムが見つかる
最大で5製品の診断結果をお届けします。検討していた製品だけでなく、思わぬ製品との出会いもあるかもしれません。
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