病院・クリニック向け勤怠管理システムおすすめ13選！

「当直やオンコールの入り組んだシフト管理が限界」「電子カルテのログと打刻のズレを手作業で確認しており現場が疲弊している」

こうした課題の解決には、医療業界に特化した「病院・クリニック向け勤怠管理システム」が有効です。特有の複雑なシフト作成機能や、電子カルテ連携による客観的な労働時間の把握機能を備えており、コンプライアンスの遵守と集計業務の効率化を実現します。

病院・クリニック向け勤怠管理システムについて、導入事例を含めて紹介します。

病院・クリニック向け勤怠管理システムおすすめTOP3

数ある勤怠管理システムの中から、病院やクリニックの意思決定層・実務責任者におすすめしたい3製品を厳選しました。主な理由は、一般的な企業向けシステムでは対応しきれない「医療現場特有の深い課題」を解決できる、高い専門性を兼ね備えている点にあります。

それぞれの製品の強みや特徴について、比較表とともに詳しく見ていきましょう。

※ミツモア調べ（2026年3月時点）

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Dr.JOY（Dr.JOY株式会社）

Dr.JOYは医療機関の多様な勤務形態に応える勤怠管理システムです。全国の大学病院や中核病院など多数の導入実績を持ち、一般的なシステムでは管理が難しい「自己研鑽（勉強や研究など）」と「労働時間」の切り分け機能や、宿日直許可の有無に応じた労働時間計算など、医師特有の複雑な労務管理に標準対応しています。

ビーコン打刻の採用も大きな特徴のひとつです。院内の受信機と携帯用の発信機が連動し、打刻漏れを防げるだけでなく、B水準やC水準への健康確保措置、医師労働時間短縮計画のガイドラインへの適合も果たせます。

医療法にもとづく立入検査要綱に対応した帳票出力機能を業界でいち早く搭載しました。急な監査にも慌てず、事務部門に負担をかけない迅速な対応が可能です。

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CWS就業管理システム（インフォコム株式会社）

CWS就業管理システムは、インフォコム株式会社が提供する、病院・クリニックに特化した就業管理パッケージです。2024年4月からの医師の時間外上限規制に対応しており、医療機関特有の勤務体制を加味した予定表作成をサポートします。

看護部門特有の2交代・3交代制、日当直やオンコールといった複雑なシフト作成にも対応。施設基準の維持に不可欠な「様式9」へ勤務実績データを連携させるだけでなく、「シフト実績と様式9の整合性チェック」にかかる時間を削減できます。

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Vicsell 勤怠管理（株式会社SCP.SOFT）

Vicsell勤怠管理は、医療や介護現場の複雑な就業ルールを支えるシステムです。職種ごとに異なる締め日、当直や夜勤の手当計算といった医療機関独自の規則に対応しており、客観的な労働時間を把握する機能に優れています。

電子カルテのログといった客観的な証拠と、打刻データを照合できるのも大きな特徴のひとつです。打刻とログの乖離、不透明な記録を可視化することで、未確定の状態をひと目で把握できるため、管理の工数を削減します。

将来的にスタッフ数や端末台数が増えても、追加のライセンス費用は発生しません。中規模から大規模の病院でも費用を気にせず、全職員へ展開可能です。

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クリニック向け勤怠管理システムおすすめ4選

クリニックや診療所で勤怠管理システムを導入する際、「様式9」や「電子カルテ連携」といった高度な機能よりも、使いやすさと価格が重視されます。スマホやICカード等での簡単な打刻に対応し、クリニックでの導入実績がある勤怠管理システムは、下記4製品です。

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ICタイムリコーダー（株式会社オープントーン）

ICタイムリコーダーは、株式会社オープントーンが提供するクラウド型の汎用勤怠管理システムです。初期費用0円、1名あたり月額165円（税込）からと低価格でありながら、有給休暇の管理やシフト作成、各種給与計算ソフトとの連携機能などを標準搭載しています。

1日の中で休憩の打刻を複数回行うことも可能です。複雑な休憩時間を手計算で差し引く手間がなくなるため、クリニック特有の悩みである「午前診と午後診の間の長い休憩（中抜け）」の管理がしやすくなります。

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KING of TIME（株式会社ヒューマンテクノロジーズ）

KING OF TIME(キングオブタイム)は、月額330円/名という低価格ながら、給与計算システムとの連携機能を備えたクラウド型勤怠管理システムです。価格でありながら、休暇管理やシフト作成、残業時間の自動計算など、勤怠管理に必要なすべての機能が「追加料金なし」で標準利用できます。

職種（看護師、医療事務など）や雇用形態（常勤、パート）ごとに異なるシフト作成に標準対応しています。クリニック特有の「午前のみ」「午後のみ」「通し勤務」といった勤務パターンをあらかじめ登録しておくことで、パズルを組み立てるようにクリック一つでシフト表を作成できます。

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Touch On Time（株式会社デジジャパン）

Touch On Time（タッチオンタイム）は、専用の打刻端末を使った勤怠管理システムです。初期費用0円、月額費用は330円×人数分という料金体系で、専任のサポートセンターによる手厚い無償サポートを受けられます。

独自の専用打刻端末「タッチオンタイムレコーダー」を提供しており、指紋認証やICカード、スタッフIDといった複数の打刻方法を1台で対応することが可能です。常勤の医師や看護師など、事前にそれぞれの勤務条件や時給、残業の計算ルール（15分単位の丸め処理など）を設定しておくことで、打刻データから自動で正確な労働時間を集計します。

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ジンジャー勤怠（jinjer株式会社）

ジンジャー勤怠は、jinjer株式会社が提供するクラウド型勤怠管理システムです。「ジンジャー人事労務」や「ジンジャー給与」と組み合わせることで、従業員情報の登録から日々の勤怠集計、毎月の給与計算までをひとつのシステム内でシームレスに連動させられます。

クリニック特有の「午前診のみ」、「午後診から」といった不規則なシフト作成を、管理画面からパズルのように直感的に組むことが可能です。作成されたシフトはスタッフのスマートフォンアプリへ即座に通知・共有され、スタッフ側もアプリから希望シフトを提出できます。

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小規模病院向け勤怠管理システムおすすめ3選

病床数が数十床規模の「小規模病院（中小病院）」で勤怠管理システムを選ぶ際、入院設備（病棟）があるため「夜勤や当直を伴う複雑なシフト管理」や「様式9の作成」が必要です。

小規模病院におすすめの勤怠管理システム3製品を紹介します。

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勤怠課長（株式会社ニューテック）

「勤怠課長」は、医療業界独自の多様な勤務体系に対応し、必要なデータをもとに様式9を自動作成する勤怠管理システムです。1ユーザーあたり月額330円から自院に必要な機能だけを柔軟にカスタマイズできます。

シフトパターンの登録数に上限がありません。病棟の2交代・3交代をはじめ、「日勤のあとに宿直に入り翌日退勤する」、「一度帰宅して、夜間に呼び出されて再度出勤する」といった、医療機関ならではの変則的な勤務に対応可能です。

日跨ぎの勤務も自動で正しく集計されるため、看護師長や労務担当者がタイムカードを見ながら手計算で時間を修正する手間を完全にゼロにする効果をもたらします。

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MOT勤怠管理（株式会社バルテックITソリューションズ）

MOT（モッテル）勤怠管理は、株式会社バルテックが提供するクラウド型システムです。「勤怠管理」と「シフト管理」の両機能をクラウド上で一元化でき、20ID（20名）まで月額4,378円の定額で利用できます。

スタッフからのシフト希望をスマートフォン（ブラウザチャット）から直接収集し、システム上のシフト表へ自動で反映させることが可能です。

小規模病院で課題となる「夜勤に急な欠員が出た」「この日の早出スタッフが足りない」といった人員の過不足が可視化されるため、看護師長やシフト管理者の調整作業を効率化し、安定した病棟の稼働をもたらします。

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ジョブカン勤怠管理（株式会社DONUTS）

ジョブカン勤怠管理は、株式会社DONUTSが提供するクラウド型の勤怠管理システムです。出勤やシフト、休暇・申請、工数管理の4つの機能から、自院に必要なものだけを自由に組み合わせて導入できます。

柔軟なデータ出力機能（CSV・Excelエクスポート）を備えており、日々の複雑なシフト実績や労働時間データを抽出し、施設基準の届出に必要な「様式9」のフォーマットへスムーズに連携させることが可能です。高額な医療特化型システムを導入しなくても、毎月師長が電卓を叩いて行っていた病棟の様式9集計作業を大幅に省力化する効果をもたらします。

2交代・3交代といった病棟特有の複雑な勤務形態にも対応しており、深夜0時をまたぐ「夜勤」や「当直」のシフトも、翌日の勤務として正しく自動集計することも可能です。

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中～大規模病院向け勤怠管理システムおすすめ3選

100床を超える中規模病院や、複数の診療科・病棟を抱える大規模病院において、勤怠管理システムの選定は「病院経営のリスク管理」に直結します。「医師の働き方改革の厳格な上限管理」や「複数病棟の様式9の自動集計」、「電子カルテ等のPC操作ログとの連携（サービス残業の監査対策）」といった要件が必要です。

中〜大規模病院向け勤怠管理システム3製品を紹介します。

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ADVANCE勤怠クラウド Hospital Edition（関彰商事株式会社）

ADVANCE勤怠クラウド Hospital Editionは、関彰商事株式会社が提供する医療機関向けの就業管理システムです。医療現場の特殊な勤務形態をシステム上で正確に処理することに特化しています。

当直や夜勤、日跨ぎなど、最大1,000種類以上の複雑なシフトパターンを登録・管理することが可能です。精緻なシフトデータと日々の打刻実績を連動させることで、看護管理者の大きな負担となっている「様式9」を自動で作成・出力します。

A水準・B水準・C水準といった複雑な時間外労働の上限規制に対し、リアルタイムで労働時間を集計し、超過の危険がある場合はアラートで警告します。自己研鑽（勉強や研究）の時間と通常の労働時間を明確に区別して記録できるため、不当な残業時間の増大を防ぎつつ、法令を遵守したクリーンな医療環境をもたらすでしょう。

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OLude（株式会社 東計電算）

OLude(オルデ)は、医療業界専門のシフト勤怠管理システムです。客観的な労働時間の把握に対する機能が充実しており、スタッフが申告した「勤怠の打刻時間」と、電子カルテシステム等の「PCのログイン・ログアウト時間」をシステム上で自動的に突き合わせます。

両者に一定以上のズレ（乖離）があった場合は自動でエラーとして抽出し、理由の申請を必須化することが可能です。これにより、病院経営の重大なリスクとなる「隠れ残業（サービス残業）」をシステム側で強制的に防ぎ、適正な労働時間の把握と評価を実現します。

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CAERU勤怠 医療（CAERU株式会社）

CAERU勤怠 医療は、CAERU株式会社が提供する医療業界に最適化された勤怠管理システムです。「初期費用・サポート費用が無料」かつ、「打刻用の専用端末（タブレットやICカードリーダーなど）を無料でレンタルできます。

本院をはじめ、複数の分院や訪問看護ステーションなど、全スタッフの勤怠を一つのクラウド上で一括に管理することが可能です。医師に対しては「診療・当直・待機・自己研鑽（勉強や研究）」といった勤務区分を正確に記録させ、働き方改革の上限規制をクリアする環境を整えます。

看護部門に対してはシフトデータをもとに「様式9」を自動で作成・出力できる機能を完備。ハードウェア等の高額な初期費用をかけずに、医師と看護師それぞれが抱える「全く異なる深い労務課題」を一つのシステムで同時に解決へと導けます。

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病院向け勤怠管理システムの導入事例

勤怠管理システムを導入した病院の導入効果や導入に至った前後の背景など、実際に導入している病院を紹介します。

事例1：個人の時間管理に対する意識が改善され、無駄な残業が減った

事例2：職員の実働を正確に把握できるようになった

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