健康管理システム比較おすすめ22選

「健康診断の結果が紙のままで、データ化できていない」

「紙の健診結果をExcelに入力する作業に、毎年膨大な時間がかかる」

「どの従業員が再検査対象か、すぐに把握できない」

ストレスチェックの導入や産業医の選任は済んでいる。しかし健康診断の管理だけは紙やExcelのまま――そんな企業は少なくありません。

こうした課題を解決できるのが、健康管理システムです。健康診断やストレスチェックなどの健康データを一元管理し、受診勧奨の自動化や労働基準監督署への報告書作成まで効率化。データをもとにした健康経営の第一歩をサポートします。

この記事では、おすすめの健康管理システムを比較し、選び方のポイントを解説します。

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健康管理システムとは、従業員の健康診断やストレスチェックなどの健康データの収集や管理、分析を効率的におこなえるクラウド型ソフトウェアです。従来の紙やExcelでの管理がシステムによって自動化され、企業のメンタルヘルス対策やデータの利活用促進を実現します。

経済産業省は「健康経営」として、「健康管理を経営的視点から考え、戦略的に実践すること」を推奨し将来の重要な経済対策の1つとして挙げています。健康管理システムは健康経営をサポートするシステムとして、より重要な役割を担っていくでしょう。

健康管理システムを必要としている企業の傾向とは？

2025年9月〜11月にかけてミツモアにおいて、健康管理システムへの関心が実際に高かった企業の傾向を紹介します。

■関心が高いのは「健康診断」の管理業務

企業が健康管理システムで管理したい対象として多かったのは以下の通りです。

• 健康診断：約74%
• 従業員のメンタルヘルス：約40%
• 産業医面談：約19%
  
  

健康診断の管理が圧倒的多数を占めており、従業員の健康状態を正確に把握し、法令遵守を実現することが企業の優先課題であることがわかります。

■必要な機能は「診断結果の一括管理」と「分析、レポート機能」

健康診断に関して企業が必要とする機能で多かったのは以下の通りです。

• 診断結果の一括管理：約54%
• 健診結果の分析、レポート機能：約43%
• 過去の健診結果の収集、データ化：約34%
• 事務手続きの効率化：約34%
  
  

多くの企業が、複数の医療機関から送られてくるバラバラな形式の健診結果を一元管理し、データとして分析できる機能を重視している実態が明らかになりました。紙やExcelでの管理から脱却し、戦略的な健康経営を実現したいというニーズが高まっています。

健康管理システムは、必要な機能を選んで組み合わせることが可能です。データ収集や分析などを自動化したり、グラフやダッシュボードを活用して、健康状態や業務の改善ポイントを直感的に把握できます。代表的な機能について紹介します。

健康管理システムを導入すると、紙やExcelで抱えていた課題を解消し、担当者の負担を大幅に軽減できます。

1.紙やExcel管理から解放される

健診結果が紙のまま倉庫に積まれている、Excelファイルがどこにあるかわからない——そんな状況から脱却できます。

健康管理システムなら、複数の医療機関から届くバラバラな形式の健診結果を自動でデータ化。過去の結果もクラウド上で一元管理でき、必要なときにすぐ検索、確認できます。

2.担当者の作業時間を大幅に削減

健診結果をExcelに手入力し、確認作業に4時間以上かかっていた——そんな業務がシステム導入で数分に短縮されます。

健康診断結果報告書やストレスチェック集団分析の報告書なども自動作成されるため、無理なく運用できます。

3.再検査対象者の見落としを防げる

「誰が再検査対象かすぐに把握できない」「対応漏れが心配」——こうした課題もシステムが解決します。

健診結果から再検査対象者を自動で抽出し、リマインド通知で受診勧奨。産業医面談が必要な従業員も一目で確認でき、フォロー漏れを防止できます。

健康管理システムは、以下の3つのポイントで選ぶことが大切です。

実際の製品比較では、「データ管理におすすめ製品」「システム連携に強い製品」の2分類から、自社の課題解決に適切なものを選びましょう。

1.人事システムや勤怠システムとの連携が必要か確認する

健康管理システムと人事・勤怠システムを連携すると、業務効率化だけでなく、過重労働者の把握や健康リスクの早期発見にもつながります。連携が必要かどうかは、自社の運用課題にあわせて判断しましょう。

すべてのシステムと完全連携する必要はありません。「従業員情報の手入力を減らしたい」「過重労働者を自動で把握したい」など、自社が解決したい課題を明確にしたうえで、必要な範囲で連携できる製品を選びましょう。

2.自動分析や予防提案機能で選ぶ

健康管理システムを選ぶ際は、システムが自動で分析し「誰に何をすべきか」を教えてくれる機能があるかを確認しましょう。

担当者が自らデータを分析するのではなく、システムに任せられる製品を選ぶと、業務負担を減らせます。 

専門知識がなくても、システムの指示に従って対応できる製品を選ぶことで、無理なく運用できます。

3.サポート体制と操作性を確認する

健康管理システムは、人事担当者だけでなく全従業員が利用する場面もあります。導入前にサポート体制と操作性の両面を確認しましょう。

サポート体制については、導入前のヒアリングや設定支援があるか、運用中の問い合わせ対応（電話、メール、チャット）が受けられるか、他社の運用事例やノウハウを共有してもらえるかを確認します。

困ったときにすぐ相談できる体制があると運用定着がスムーズです。

操作性については、PCが苦手な従業員でも操作できるシンプルな画面かどうかが重要です。導入前にデモやトライアルで実際の使用感を確認できるかも聞いておきましょう。

システムを導入しても使いこなせなければ意味がありません。

健康管理システムの主要製品を比較しました。（表は横にスクロールします）

製品名	Carely	Growbase	バリューHR	Be Health	コンレポ	Wellness Eye	HM-neo	HealthCare iris	mediment
ロゴ
特徴	健診・ストレスチェックを一括管理、対象者を自動リストアップ	複数医療機関の健診データを自動で統一形式に変換	健診予約代行から結果管理まで一括でお任せ	健診データ統一ツールで複数機関のデータを標準化	毎日の体調報告をリアルタイム集約、異常を自動通知	独自設問でストレス要因を可視化、優先対処を提示	複数拠点のデータを一元管理、帳票も自動作成	複数医療機関のデータ形式を自動統一、検索も簡単	勤怠データ取込で過重労働者を自動抽出、API連携対応
初期費用	要問合せ	要問合せ	要問合せ	要問合せ	要問合せ	要問合せ	要問合せ	要問合せ	要問合せ
月額費用	要問合せ	要問合せ	要問合せ	要問合せ	要問合せ	要問合せ	要問合せ	要問合せ	要問合せ
無料トライアル	－	－	－	－	14日	－	－	－	－
健康診断管理	○	○	○	○	○	－	○	○	○
ストレスチェック	○	○	○	○	○	○	○	○	○
面談記録	○	○	○	○	－	－	○	○	○
労基署報告資料作成	○	○	○	○	－	－	○	○	○
データ形式の統一化	○	○	－	○	－	－	－	○	○
健康診断予約	○	○	－	－	－	－	－	○	○
API連携	○	－	－	○	○	－	－	－	○
CSV連携	○	○	○	○	○	○	○	○	○
データ分析	○	○	○	○	－	○	○	－	○
導入実績	600社以上	1,800社以上	－	400社以上	－	510社	－	－	－

※ミツモア調べ(2025年12月現在)、各社公式サイトより

システム導入が、実際の現場でどのように活用され、どのような成果につながっているか。具体的な事例を紹介します。

製造業でのメンタルヘルスDX事例

• 導入企業：株式会社ニチレイ
• 導入製品：ハピネスパートナーズ（エムスリーヘルスデザイン株式会社）
  
  
• 課題：他社の健康管理システムを導入していたが、操作が複雑で全国の産業医選任事業場でのシステム利用を徹底できなかった。結果として、紙による管理も一部で発生し、健康管理業務の効率化が進まなかった。複数拠点を持つ大規模組織において、従業員の健康状態を統一的に把握することが困難だった。
  
  
• 成果：操作画面がわかりやすく、誰でも簡単に操作できるシステムを導入したことで、全国の産業医選任事業場でのシステム利用が徹底された。自社の独自基準で健診結果を判定できる機能により、従業員の健康状態を統一基準で把握できるようになった。紙管理からの脱却により、健康管理業務の効率化と、全従業員の健康データの一元管理を実現。メンタルヘルス対策を含む包括的な健康管理体制を構築し、産業保健スタッフの業務負担を大幅に削減した。
  
  

関連記事：ハピネスパートナーズの導入事例｜ミツモア

IT企業でのウェルビーイング指標導入事例

• 導入企業：株式会社インフォマート
• 導入製品：Carely（株式会社iCARE）
  
  
• 課題：テレワーク勤務への切り替えにより、従業員の健康状態が物理的に見えなくなり、運動機会の減少やコミュニケーション不足による健康リスクが顕在化。健康診断は紙で管理し、ストレスチェックは他社サービスで実施する二元管理の状態で、従業員の健康予防（一次予防）の仕組みが構築できていなかった。法令遵守と業務効率化の両立も課題だった。
  
  
• 成果：Carelyで健康診断結果とストレスチェックを一元管理し、就業管理システムとも連携。従業員500名が参加する説明会を開催したことで、オンライン健康相談の利用率が平均1%から5%へ劇的に向上。従業員が自分の健診結果をオンラインで確認、管理できるようになり、従業員満足度が向上した。蓄積されたデータを活用し、メンタルヘルス不調の兆候を能動的に捉えて業務負荷調整などの一次予防をおこなう体制を構築。テレワークと出社のハイブリッド勤務環境において、働きやすい職場環境の改善を実現した。
  
  

関連記事：Carely(ケアリィ)の導入事例｜ミツモア

健康管理システムを導入する前に、以下の3つのポイントを確認しておきましょう。

1.導入後の乗り換えは難しいことを理解する

健康管理システムは、一度導入すると乗り換えには大きな工数や手間がかかる場合があります。過去の健診データの移行、新システムへの再学習、従業員への再周知など、切り替えには大きな労力がかかります。

「とりあえず導入して、あわなければ変えればいい」という考え方はおすすめしません。導入前の段階で、自社の課題に本当にあった製品かどうかを十分に見極めることが重要です。

導入前には、従業員数が増えたときや新しい機能が必要になったときに対応できるか、将来の拡張性を確認しましょう。また、最低契約期間や途中解約時の条件、万が一乗り換える際に蓄積したデータを取り出せるか（データエクスポートの可否）も確認しておくと安心です。

2.既存のストレスチェックや産業医システムとの関係を整理する

多くの企業では、法令対応ですでにストレスチェックや産業医面談体制を整備済みです。健康管理システムを検討する際は、これらの既存システムとの関係を整理しましょう。

選択肢は主に2つあります。

一元化は、健康管理システムにストレスチェックや産業医面談機能も統合し、既存サービスを解約する方法です。健診データ、ストレスチェック結果、面談記録をまとめて管理でき、運用コストも削減できます。

併用は、既存のストレスチェックや産業医サービスはそのまま継続し、健康管理システムは健診管理に特化させる方法です。ストレスチェック機能を外せば費用を抑えられる製品もあります。

併用する場合は、既存サービスとデータ連携できるかを確認しましょう。連携できれば、健診データとストレスチェック結果を組みあわせた分析も可能になります。

3.セキュリティ対策を確認する

健康管理システムを選定する際は、セキュリティ対策が十分におこなわれているかを必ず確認してください。

まず、ISMSやプライバシーマークなどセキュリティ認証の取得状況を確認しましょう。データセンターが国内にあるか、通信時と保存時の両方でデータが暗号化されているかも重要な確認項目です。

また、従業員ごとに閲覧権限を細かく設定できるアクセス制御機能があるか、誰がいつどのデータにアクセスしたかの記録が残るログ管理機能があるかも確認しておきましょう。

リモートワークが普及した現在、ゼロトラストセキュリティ（すべてのアクセスを検証する考え方）に対応したシステムを選ぶと、場所を問わず安全に健康データを扱えます。複数拠点を持つ企業や在宅勤務を導入している企業は、ゼロトラスト対応の有無も確認しておきましょう。

健康管理システムは製品によって特徴や機能もさまざま。「どの製品を選べばいいかわからない・・・」といった方も多いのではないでしょうか。

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